RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PATJQ8NI35 1801 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KIAA0355O15063 1070 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MDM4O15151 490 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PENKP01210 267 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC35G4P0C7Q5 338 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RRADP55042 308 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GAS2L3Q86XJ1 694 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KATNAL2Q8IYT4 538 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ABHD11Q8NFV4 315 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TPRKBQ9Y3C4 175 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KERAO60938 352 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF432O94892 652 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 INMTO95050 263 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TFRCP02786 760 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CYP3A7P24462 503 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SYT10Q6XYQ8 523 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC15A3Q8IY34 581 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 STAG3L4Q8TBR4 150 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DEFB129Q9H1M3 183 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HOXA9P31269 272 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CYP27A1Q02318 531 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRKCZQ05513 592 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SCRN3Q0VDG4 424 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CNDP1Q96KN2 507 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SMYD3Q9H7B4 428 aa4.54□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CLOCKO15516 846 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ATP9AO75110 1047 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PDHA1P08559 390 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 THPOP40225 353 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CD151P48509 253 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ARFIP1P53367 373 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TYSND1Q2T9J0 566 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TCTE1Q5JU00 501 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SUSD4Q5VX71 490 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HSDL2Q6YN16 418 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DEDD2Q8WXF8 326 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRFN5Q96NI6 719 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UCHL3P15374 230 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SCRN1Q12765 414 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SEMA5AQ13591 1074 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AMER2Q8N7J2 671 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GOLM1Q8NBJ4 401 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RFT1Q96AA3 541 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HPDLQ96IR7 371 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ELMO2Q96JJ3 720 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC6A7Q99884 636 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM121Q9BTD3 319 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC28A3Q9HAS3 691 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM153AQ9UHL3 310 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 VANGL2Q9ULK5 521 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BAIAP2Q9UQB8 552 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SEC16AO15027 2179 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ESYT3A0FGR9 886 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM86C2PA6NEL3 165 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CER1O95813 267 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRP8Q14114 963 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DSC3Q14574 896 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HSDL1Q3SXM5 330 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPDYE7PQ495Y7 208 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPIN4Q56A73 249 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SEL1L3Q68CR1 1132 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CENPTQ96BT3 561 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 COQ7Q99807 217 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MAFO75444 373 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EPB42P16452 691 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LIG3P49916 1009 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RAB14P61106 215 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TUBA4AP68366 448 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C1orf146Q5VVC0 180 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR6C65A6NJZ3 312 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RTCAO00442 366 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PEX10O60683 326 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NDST3O95803 873 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ALOX5P09917 674 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MVKQ03426 396 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RING1Q06587 406 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CD47Q08722 323 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC13A2Q13183 592 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PROSER3Q2NL68 480 aa4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms