RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 POLIQ9UNA4 740 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.672e-6■■■■□ 22.1
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A087WZ62 844 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GSAPA4D1B5 854 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 HMX3A6NHT5 357 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ALG1L2C9J202 215 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPAN3O60637 253 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF623O75123 536 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 WFS1O76024 890 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SLITRK5O94991 958 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 FUCA1P04066 466 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT3P12035 628 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 BMP2P12643 396 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TCP1P17987 556 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC5A2P31639 672 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CASP4P49662 377 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 VSNL1P62760 191 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP11AP98196 1134 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PMS2P3Q13401 168 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ITGA9Q13797 1035 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MORF4L2Q15014 288 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 NECTIN1Q15223 517 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TIGD6Q17RP2 521 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GTDC1Q4AE62 458 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 HAUS6Q7Z4H7 955 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 OR8H3Q8N146 312 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MLKLQ8NB16 471 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC5A5Q92911 643 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZDHHC12Q96GR4 267 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNC2Q96PR1 638 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PCYT2Q99447 389 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CDC6Q99741 560 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MAN1C1Q9NR34 630 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 KLHL11Q9NVR0 708 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PKD2L2Q9NZM6 624 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 WNT16Q9UBV4 365 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 NUP50Q9UKX7 468 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 KAT6AQ92794 2004 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC14BA6NHZ5 514 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 H7C4K7 107 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 AGPSO00116 658 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 C2CD2LO14523 706 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF197O14709 1029 aa4.59□□□□□ -1.67
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RABGGTB-213ENST00000496055 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
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RABGGTB-213ENST00000496055 NDUFS2O75306 463 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CCNKO75909 580 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CCNE2O96020 404 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SOD2P04179 222 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ODC1P11926 461 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PRG2P13727 222 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PFKLP17858 780 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CALB2P22676 271 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GTF2H1P32780 548 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GPD2P43304 727 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GSTM5P46439 218 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RABIFP47224 123 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CASP6P55212 293 aa4.59□□□□□ -1.67
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RABGGTB-213ENST00000496055 TRADDQ15628 312 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 LTB4RQ15722 352 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
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RABGGTB-213ENST00000496055 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
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RABGGTB-213ENST00000496055 SLC43A2Q8N370 569 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 LNX2Q8N448 690 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DTWD2Q8NBA8 298 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 QRFPRQ96P65 431 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TXLNGYQ9BZA5 131 aa4.59□□□□□ -1.67
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RABGGTB-213ENST00000496055 C11orf16Q9NQ32 467 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 NUDT15Q9NV35 164 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TBC1D13Q9NVG8 400 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RCOR1Q9UKL0 485 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDHA7Q9UN72 937 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 IRAK3Q9Y616 596 aa4.59□□□□□ -1.67
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