RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493945.5

ACTB-213, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,236 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-213ENST00000493945 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 APPL1Q9UKG1 709 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 DMTF1Q9Y222 760 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 TCAF1Q9Y4C2 921 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ESYT3A0FGR9 886 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 PLK4O00444 970 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 POLBP06746 335 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 C6P13671 934 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 PGAM1P18669 254 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 MGAT1P26572 445 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 AKT2P31751 481 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 SPAM1P38567 509 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 PXNP49023 591 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 STC1P52823 247 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 METAP1P53582 386 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 DCDC1P59894 354 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 PRAMEP78395 509 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 CNGA3Q16281 694 aa14.92□□□□□ -0.02
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ACTB-213ENST00000493945 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.92□□□□□ -0.02
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ACTB-213ENST00000493945 ZNF765Q7L2R6 523 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 CCDC25Q86WR0 208 aa14.92□□□□□ -0.02
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ACTB-213ENST00000493945 TOR1BO14657 336 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ERLIN1O75477 346 aa14.91□□□□□ -0.02
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ACTB-213ENST00000493945 PIRTP0C851 137 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 TDGF1P13385 188 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ACSL1P33121 698 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 MAGEA3P43357 314 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 RALGDSQ12967 914 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ITGA9Q13797 1035 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 IHHQ14623 411 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 CCDC38Q502W7 563 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 PDPK2PQ6A1A2 396 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 TSSK4Q6SA08 328 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 RABEPKQ7Z6M1 372 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 RLN3Q8WXF3 142 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 SNX19Q92543 992 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 KCNH6Q9H252 994 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ITM2BQ9Y287 266 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 VCANP13611 3396 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 F8W8V4 182 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 MAGEC1O60732 1142 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 MMP20O60882 483 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 USP1O94782 785 aa14.9□□□□□ -0.02
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ACTB-213ENST00000493945 CLDN7O95471 211 aa14.9□□□□□ -0.02
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ACTB-213ENST00000493945 TPH1P17752 444 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ITGALP20701 1170 aa14.9□□□□□ -0.02
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ACTB-213ENST00000493945 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 CERCAMQ5T4B2 595 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 TSTD2Q5T7W7 516 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 WDR93Q6P2C0 686 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ZNF534Q76KX8 674 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 PALM2Q8IXS6 379 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 CALML6Q8TD86 181 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 VOPP1Q96AW1 172 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 DTD2Q96FN9 168 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 KIFC1Q9BW19 673 aa14.9□□□□□ -0.02
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