RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 A0A087WWV3 80 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 A0A0U1RQF3 1178 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 OR2W5A6NFC9 320 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TP73O15350 636 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 FFAR2O15552 330 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC37A4O43826 429 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 EDIL3O43854 480 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PSMD10O75832 226 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 DEXIO95424 95 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 KLRC2P26717 231 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SFNP31947 248 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PBX1P40424 430 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PSMC5P62195 406 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 UBE3AQ05086 875 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 DEUP1Q05D60 604 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 COASYQ13057 564 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MTAPQ13126 283 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 BIRC2Q13490 618 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 FHL3Q13643 280 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ETFDHQ16134 617 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TMTC4Q5T4D3 741 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ANKRD54Q6NXT1 300 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM65Q6PI78 240 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF813Q6ZN06 617 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 RUFY3Q7L099 469 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 RASGRP3Q8IV61 690 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 VPS52Q8N1B4 723 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC39A11Q8N1S5 342 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 LINC01465Q8N7H1 131 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 NECAB1Q8N987 351 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF527Q8NB42 609 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 RNF149Q8NC42 400 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SMRP1Q8NCR6 262 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF398Q8TD17 642 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 DENND1AQ8TEH3 1009 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CRYGNQ8WXF5 182 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC39A13Q96H72 371 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CEP170P1Q96L14 293 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 HS6ST2Q96MM7 605 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 WDR24Q96S15 920 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 NUDT22Q9BRQ3 303 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 EFHD1Q9BUP0 239 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TTLL2Q9BWV7 592 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CWH43Q9H720 699 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 USP29Q9HBJ7 922 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PLCB1Q9NQ66 1216 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SH3GLB2Q9NR46 395 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 DACT1Q9NYF0 836 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 HES2Q9Y543 173 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 LTBP2Q14767 1821 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 FOCADQ5VW36 1801 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 C2CD4DB7Z1M9 353 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 LOC730098B7Z3J9 87 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 FCHO1O14526 889 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ERLIN2O94905 339 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 GALTP07902 379 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 EPCAMP16422 314 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 XBP1P17861 261 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 DRD1P21728 446 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 YWHABP31946 246 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MLH1P40692 756 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MMP13P45452 471 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 GSTM5P46439 218 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 OR1G1P47890 313 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 QARSP47897 775 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC11A1P49279 550 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 VCPP55072 806 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 KRTAP10-11P60412 298 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CFHR3Q02985 330 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC15Q0P6D6 951 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 KCNJ12Q14500 433 aa3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms