RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 OR4C6Q8NH72 309 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 LMX1AQ8TE12 382 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 CHP1Q99653 195 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 NUP85Q9BW27 656 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 CLPBQ9H078 707 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 PRORYQ9H606 182 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 DKK3Q9UBP4 350 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 NENFQ9UMX5 172 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 RP1P56715 2156 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 A0A1W2PQJ5 194 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 TSPAN11A1L157 253 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 YKT6O15498 198 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 MAFKO60675 156 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 MT-CO3P00414 261 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 SERPING1P05155 500 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 CYP1A2P05177 515 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 C6P13671 934 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 PLA2G2AP14555 144 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 ACP1P24666 158 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 PCK1P35558 622 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 RABIFP47224 123 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 HCAR3P49019 387 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 LIG3P49916 1009 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 SCNN1BP51168 640 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 ARSEP51690 589 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 EPHA4P54764 986 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 ADKP55263 362 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 MAXP61244 160 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 DAB2P98082 770 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 RAD51Q06609 339 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 IL10RBQ08334 325 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 UGP2Q16851 508 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 PERM1Q5SV97 790 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 RFLNAQ6ZTI6 216 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 RD3Q7Z3Z2 195 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 GALNT15Q8N3T1 639 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF843Q8N446 348 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 CXorf40AQ8TE69 158 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 ASB12Q8WXK4 309 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 RAB7BQ96AH8 199 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 CSPG4P5Q96PW8 444 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC30A3Q99726 388 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 NCAPGQ9BPX3 1015 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 APOOQ9BUR5 198 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 SP110Q9HB58 689 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 KIF26BQ2KJY2 2108 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 CPED1A4D0V7 1026 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 YY2O15391 372 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 AQP9O43315 295 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 OPA1O60313 960 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 FUCA1P04066 466 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 PCCBP05166 539 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 C1SP09871 688 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 CKMT1AP12532 417 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 TSHRP16473 764 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 CR2P20023 1033 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 TGM2P21980 687 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 GJC1P36383 396 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 SSR1P43307 286 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 CSNK1DP48730 415 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 CDH6P55285 790 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 TRAF2Q12933 501 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 INPP5AQ14642 412 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 DPYSL2Q16555 572 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 CDKN3Q16667 212 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 INAVAQ3KP66 663 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 BOLA3Q53S33 107 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 FAXCQ5TGI0 409 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 GUSBP11Q6P575 273 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 ENPP7Q6UWV6 458 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-208ENST00000490653 LIPIQ6XZB0 460 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms