RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 SOX7Q9BT81 388 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SDCBP2Q9H190 292 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A1B0GTQ1 180 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A1B0GVC2 190 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TGFB1I1O43294 461 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM127O75204 238 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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APOBEC3G-206ENST00000486357 C1SP09871 688 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CDK4P11802 303 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 FOSL1P15407 271 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 HOXD13P35453 343 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ACTN2P35609 894 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC6A9P48067 706 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 HSPA7P48741 367 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 AP3M2P53677 418 aa7.33□□□□□ -1.24
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APOBEC3G-206ENST00000486357 CHRNEQ04844 493 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ENPP2Q13822 863 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 DAG1Q14118 895 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CNGA2Q16280 664 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 BMT2Q1RMZ1 405 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 MPEG1Q2M385 716 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 KIAA0895LQ68EN5 471 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM173BQ6P4H8 233 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CLEC20AQ6ZU45 233 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CHST9Q7L1S5 443 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 UNC93AQ86WB7 457 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CRYBG2Q8N1P7 616 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 C3orf20Q8ND61 904 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 DHX58Q96C10 678 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC2A11Q9BYW1 496 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.33□□□□□ -1.24
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APOBEC3G-206ENST00000486357 SGK2Q9HBY8 427 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 HMGXB4Q9UGU5 601 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CLEC4EQ9ULY5 219 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.33□□□□□ -1.24
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APOBEC3G-206ENST00000486357 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.33□□□□□ -1.24
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APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A1W2PPC4 97 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF839A8K0R7 811 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ISM1B1AKI9 464 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 VILLO15195 856 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 RHOBTB3O94955 611 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CSTBP04080 98 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CD58P19256 250 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 GLDCP23378 1020 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 PIK3CAP42336 1068 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAPK9P45984 424 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 HARS2P49590 506 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAPK10P53779 464 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ST8SIA6P61647 398 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 RPS14P62263 151 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZBTB16Q05516 673 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 NOMO1Q15155 1222 aa7.32□□□□□ -1.24
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APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM215Q68D42 235 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPOPLQ6IQ16 392 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMC6Q7Z403 805 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 SCD5Q86SK9 330 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARHGAP18Q8N392 663 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 GPR156Q8NFN8 814 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CALML6Q8TD86 181 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 GOLGA1Q92805 767 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 P2RY11Q96G91 374 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 PEX11GQ96HA9 241 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 C7orf25Q9BPX7 421 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 IMPG2Q9BZV3 1241 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRSS16Q9NQE7 514 aa7.32□□□□□ -1.24
APOBEC3G-206ENST00000486357 GDF3Q9NR23 364 aa7.32□□□□□ -1.24
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