RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 NOD2Q9HC29 1040 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 SYCE3A1L190 88 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 PRSS38A1L453 326 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 D6RAR5 112 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 ERVH48-1M5A8F1 160 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 PSMD11O00231 422 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 PLD2O14939 933 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 ITGA2BP08514 1039 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 JMJD7P0C870 316 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 TCF4P15884 667 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 VAC14Q08AM6 782 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 PEX6Q13608 980 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 CNGA3Q16281 694 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 C14orf28Q4W4Y0 310 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 RAET1GQ6H3X3 334 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 NYAP1Q6ZVC0 841 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 LUZP1Q86V48 1076 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 JAMLQ86YT9 394 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 PGBD5Q8N414 524 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 GPR156Q8NFN8 814 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 BTBD6Q96KE9 485 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 COQ10AQ96MF6 247 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 LGR4Q9BXB1 951 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 GSDMCQ9BYG8 508 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 FOXP3Q9BZS1 431 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 CBX8Q9HC52 389 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 LRIT1Q9P2V4 623 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 RABGEF1Q9UJ41 708 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 CAPN8A6NHC0 703 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 CDRT15L2A8MXV6 281 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 PNLIPP16233 465 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 CR2P20023 1033 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 EPHB1P54762 984 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 HGSNATQ68CP4 663 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 OGFOD3Q6PK18 319 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 HEATR4Q86WZ0 1026 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 SPOCK2Q92563 424 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 NT5MQ9NPB1 228 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 APPL1Q9UKG1 709 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 KIF26BQ2KJY2 2108 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 PGLSO95336 258 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 PRB1P04280 392 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 CYP1A2P05177 515 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 TPM3P06753 285 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 GJC1P36383 396 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 TRAF2Q12933 501 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 CCDC81Q6ZN84 652 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 CLEC14AQ86T13 490 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 KCTD6Q8NC69 237 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 TMEM159Q96B96 161 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 DTD2Q96FN9 168 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 SCRN2Q96FV2 425 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 SEMA3CQ99985 751 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ACTB-212ENST00000484841 A0A087X0T9 212 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PQM1 296 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 RHPN2P1A8MT19 583 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CASC3O15234 703 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PEX11BO96011 259 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 FAM228BP0C875 321 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CCNB1P14635 433 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CTPS1P17812 591 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 GM2AP17900 193 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CA4P22748 312 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CCKBRP32239 447 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ETV3P41162 512 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 GPR1P46091 355 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 GNPDA1P46926 289 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PDX1P52945 283 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CDK3Q00526 305 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 MAP9Q49MG5 647 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 KCTD16Q68DU8 428 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CCL4L1Q8NHW4 92 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa20.14■□□□□ 0.81
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