RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480447.5

NOP56-212, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 651 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-212ENST00000480447 MANEALQ5VSG8 457 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 GUSBP11Q6P575 273 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 NLRP14Q86W24 1093 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 CMKLR1Q99788 373 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 FZD3Q9NPG1 666 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 APPL1Q9UKG1 709 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 SATB2Q9UPW6 733 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 U3KQA8 63 aa6.31□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 A0A1W2PQC6 194 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 SIGLEC16A6NMB1 481 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 I6L893 689 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 RAD51BO15315 384 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 GCATO75600 419 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 C1QL1O75973 258 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 NEBLO76041 1014 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 TMCC1O94876 653 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 LRIG2O94898 1065 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 CD160O95971 181 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 JMJD7P0C870 316 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 KRT10P13645 584 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 TSHRP16473 764 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 NME2P22392 152 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 SERPINA4P29622 427 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 CCKBRP32239 447 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 SOX5P35711 763 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 ACVRL1P37023 503 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 STAT1P42224 750 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 RENBPP51606 427 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 CLDN6P56747 220 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 SRP54P61011 504 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 RHOAP61586 193 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 MTM1Q13496 603 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 SERINC3Q13530 473 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 NFATC4Q14934 902 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 UGP2Q16851 508 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 CCDC14Q49A88 953 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 MIIPQ5JXC2 388 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 NAA35Q5VZE5 725 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 VPS36Q86VN1 386 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 LZTR1Q8N653 840 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 C3orf20Q8ND61 904 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 ELOA3Q8NG57 546 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 TTC9Q92623 222 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 SGF29Q96ES7 293 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 HMCESQ96FZ2 354 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.42e-7■■■□□ 16.3
NOP56-212ENST00000480447 SEMA3CQ99985 751 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 CNPY3Q9BT09 278 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 CLMPQ9H6B4 373 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 UBP1Q9NZI7 540 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 ADAM22Q9P0K1 906 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 DNAI1Q9UI46 699 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 GPR34Q9UPC5 381 aa6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NOP56-212ENST00000480447 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms