RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467065.1

UBXN4-205, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN4, Length 334 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-205ENST00000467065 GPS1Q13098 491 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SGCGQ13326 291 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 MPP3Q13368 585 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 TAZQ16635 292 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 AADACL2Q6P093 401 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 USP45Q70EL2 814 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 CREG2Q8IUH2 290 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 TMIEQ8NEW7 156 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 KLK6Q92876 244 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 GATA6Q92908 595 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ARRDC3Q96B67 414 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SKA1Q96BD8 255 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SERAC1Q96JX3 654 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 TEKT5Q96M29 485 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PSKH2Q96QS6 385 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SEMA3CQ99985 751 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 LRRC40Q9H9A6 602 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 RAD18Q9NS91 495 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 NEU3Q9UQ49 428 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 CA5BQ9Y2D0 317 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.65□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.65□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CHD6Q8TD26 2715 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ADAMTS20P59510 1910 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 A0A1W2PR77 199 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 MAGEB16A2A368 324 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 C2orf81A6NN90 581 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 F8W8V4 182 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SLC7A4O43246 635 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 LATO43561 262 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ZMPSTE24O75844 475 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CRTAMO95727 393 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PROS1P07225 676 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 APRTP07741 180 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PAMP19021 973 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ITIH2P19823 946 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 TAS2R38P59533 333 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CDK16Q00536 496 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PCSK7Q16549 785 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CCDC157Q569K6 752 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 AFMIDQ63HM1 303 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CASC4Q6P4E1 433 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 GLRX5Q86SX6 157 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 TRIM69Q86WT6 500 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 PDIK1LQ8N165 341 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 OR6K2Q8NGY2 324 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 IFT81Q8WYA0 676 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-205ENST00000467065 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms