RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 HDAC8Q9BY41 377 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 DKK3Q9UBP4 350 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 GGT7Q9UJ14 662 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SCML1Q9UN30 329 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ITM2BQ9Y287 266 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CTAGE15A4D2H0 777 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PRR23AA6NEV1 266 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM47DPA6NHR8 397 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 E7EVH7 732 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PSMD3O43242 534 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 RAD51CO43502 376 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 USP12O75317 370 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF217O75362 1048 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ALPIP09923 528 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PIRTP0C851 137 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CTAGE8P0CG41 777 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 BCKDHBP21953 392 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 OXTRP30559 389 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ACSL1P33121 698 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ADRA1AP35348 466 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ADCY8P40145 1251 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CHRNA4P43681 627 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM193AP78312 1265 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC14A2Q15849 920 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 HIF1AQ16665 826 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 UGP2Q16851 508 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SIRPB2Q5JXA9 342 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 KCTD11Q693B1 232 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 C4orf22Q6V702 233 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CTAGE6Q86UF2 777 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 KBTBD6Q86V97 674 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CTAGE4Q8IX94 777 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CEP112Q8N8E3 955 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 RMDN1Q96DB5 314 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 FEM1CQ96JP0 617 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIB3Q96RU7 358 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 FSD1LQ9BXM9 530 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM31Q9BZY9 425 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 VPS45Q9NRW7 570 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ASIC3Q9UHC3 531 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PHTF1Q9UMS5 762 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 FADS3Q9Y5Q0 445 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TBC1D3EA0A087X179 549 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PQ67 120 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 GOLGA6CA6NDK9 693 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TBC1D3LB9A6J9 549 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 H0Y858 1186 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 NEMP1O14524 444 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC7A4O43246 635 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 MMP20O60882 483 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 NDUFS2O75306 463 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PCDH8O95206 1070 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SEMA4FO95754 770 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 AP2A1O95782 977 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 NDST3O95803 873 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 IGLV3-19P01714 112 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 APRTP07741 180 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TBC1D3HP0C7X1 549 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 GOLGA6DP0CG33 693 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TPH1P17752 444 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ADH6P28332 368 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CD6P30203 668 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 HNF1BP35680 557 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 GRIA1P42261 906 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ADPRHP54922 357 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms