RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460170.2

PTPRU-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-205ENST00000460170 MAPRE3Q9UPY8 281 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 GPX6P59796 221 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 STYXQ8WUJ0 223 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 NTAN1Q96AB6 310 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 COPS8Q99627 209 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 RNF208Q9H0X6 261 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 OCM2P0CE71 109 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 RFX3P48380 749 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 CYP2A13Q16696 494 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 FBXL19Q6PCT2 694 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 GPR88Q9GZN0 384 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 RAD18Q9NS91 495 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 CCL23P55773 120 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 ACAP2Q15057 778 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 TSTD2Q5T7W7 516 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 RPN2P04844 631 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 GRIA1P42261 906 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 ST13P50502 369 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 C21orf59P57076 290 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 KCNJ11Q14654 390 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 GPR180Q86V85 440 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 MPP5Q8N3R9 675 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 TRIM17Q9Y577 477 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-205ENST00000460170 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 GLTPD2A6NH11 291 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 IMPDH2P12268 514 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 TACR2P21452 398 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 FSTL1Q12841 308 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SYPL2Q5VXT5 272 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 BNIPLQ7Z465 357 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 DSG4Q86SJ6 1040 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 GRK4P32298 578 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PBX3P40426 434 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 TAS2R39P59534 338 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ATP1A4Q13733 1029 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 BROXQ5VW32 411 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 MTSS1LQ765P7 747 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 RABGGTBP53611 331 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 RALGDSQ12967 914 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 FGD3Q5JSP0 725 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CASP12Q6UXS9 341 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF614Q8N883 585 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PHLPP1O60346 1717 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 FZD9O00144 591 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ASGR1P07306 291 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 DPYSQ14117 519 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SPRYD7Q5W111 196 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CNSTQ6PJW8 725 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SEC14L1Q92503 715 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 OSBPL6Q9BZF3 934 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PALMDQ9NP74 551 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 C5P01031 1676 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CCL22O00626 93 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 TIPRLO75663 272 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 MSS51Q4VC12 460 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 EBF4Q9BQW3 602 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PTPRJQ12913 1337 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 H3BN98 237 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 NDST2P52849 883 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 BLMHQ13867 455 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 DGUOKQ16854 277 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms