RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 SFNP31947 248 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 CCR5P51681 352 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 JAK3P52333 1124 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 BPIFB4P59827 614 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC7A9P82251 487 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 SETQ01105 290 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 OVGP1Q12889 678 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 CHAF1BQ13112 559 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 ENPP2Q13822 863 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 CAPSQ13938 189 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC142Q17RM4 750 aa4.83□□□□□ -1.64
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RABGGTB-203ENST00000459697 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 TPGS1Q6ZTW0 290 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 MIER3Q7Z3K6 550 aa4.83□□□□□ -1.64
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RABGGTB-203ENST00000459697 SLC35F3Q8IY50 421 aa4.83□□□□□ -1.64
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RABGGTB-203ENST00000459697 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 ANKRD53Q8N9V6 530 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 ACRBPQ8NEB7 543 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 GPR150Q8NGU9 434 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 UCMAQ8WVF2 138 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 SORCS1Q8WY21 1168 aa4.83□□□□□ -1.64
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RABGGTB-203ENST00000459697 OTUB2Q96DC9 234 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 TAAR9Q96RI9 348 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 GPHA2Q96T91 129 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 IL12RB2Q99665 862 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 CALN1Q9BXU9 219 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 UNC45AQ9H3U1 944 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 LIME1Q9H400 295 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 FBXL12Q9NXK8 326 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 SERGEFQ9UGK8 458 aa4.83□□□□□ -1.64
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RABGGTB-203ENST00000459697 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 MYH10P35580 1976 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 TENM1Q9UKZ4 2725 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.641e-7■■□□□ 14.1
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A1W2PQM1 296 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 UBE2QL1A1L167 161 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 TLCD2A6NGC4 264 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 F5H423 210 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
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RABGGTB-203ENST00000459697 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
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RABGGTB-203ENST00000459697 SDHAP31040 664 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 SPAM1P38567 509 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 STAT1P42224 750 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 CCL11P51671 97 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 VAMP7P51809 220 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 OSTNP61366 133 aa4.82□□□□□ -1.64
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RABGGTB-203ENST00000459697 C16orf72Q14CZ0 275 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 ALX1Q15699 326 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 CHRNA6Q15825 494 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 GEN1Q17RS7 908 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 PRR16Q569H4 304 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 RABL3Q5HYI8 236 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
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RABGGTB-203ENST00000459697 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
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RABGGTB-203ENST00000459697 LRWD1Q9UFC0 647 aa4.82□□□□□ -1.64
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RABGGTB-203ENST00000459697 TNNQ9UQP3 1299 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 POLEQ07864 2286 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 RYR1P21817 5038 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 HYDINQ4G0P3 5121 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-203ENST00000459697 TBC1D3EA0A087X179 549 aa4.81□□□□□ -1.64
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