RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 C14orf28Q4W4Y0 310 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 BOLA3Q53S33 107 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 OGFOD3Q6PK18 319 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB11FIP2Q7L804 512 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 POLNQ7Z5Q5 900 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 SPRED1Q7Z699 444 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 ATPAF2Q8N5M1 289 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 GPR156Q8NFN8 814 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 OR6C4Q8NGE1 309 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 NUS1Q96E22 293 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIM11Q96F44 468 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 COQ10AQ96MF6 247 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CSPG4P5Q96PW8 444 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 DPEP2Q9H4A9 486 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF215Q9Y6U7 377 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 TENM4Q6N022 2769 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 PRSS38A1L453 326 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 GOLGA6CA6NDK9 693 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 GOLGA6BA6NDN3 693 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 MAFKO60675 156 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 SOCS5O75159 536 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 GOLGA6DP0CG33 693 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 RARAP10276 462 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 PLA2G2AP14555 144 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 GLB1P16278 677 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CR2P20023 1033 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CCKBRP32239 447 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 VIPR1P32241 457 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 MAXP61244 160 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAF2Q12933 501 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 ARHGEF7Q14155 803 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 LY6DQ14210 128 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 NR1I3Q14994 352 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 PTPRRQ15256 657 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC81Q6ZN84 652 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF605Q86T29 641 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 TTC9Q92623 222 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 BTBD6Q96KE9 485 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM74Q96NL1 305 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 NUDCD1Q96RS6 583 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 MGME1Q9BQP7 344 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 SEMA4CQ9C0C4 833 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 ISCUQ9H1K1 167 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 PCDH18Q9HCL0 1135 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 LRIT1Q9P2V4 623 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 PISDQ9UG56 409 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 APPL1Q9UKG1 709 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 LOXL2Q9Y4K0 774 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A0U1RQS6 177 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1W2PQ67 120 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 K7ENP7 123 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 SERPINC1P01008 464 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 FUCA1P04066 466 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CEACAM5P06731 702 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 JMJD7P0C870 316 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CTPS1P17812 591 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 LHCGRP22888 699 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 MMP13P45452 471 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 GNPDA1P46926 289 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 POLD2P49005 469 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 MAZP56270 477 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 KRT81Q14533 505 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 TGIF1Q15583 401 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 AMZ1Q400G9 498 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 MARC1Q5VT66 337 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 HGSNATQ68CP4 663 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 Q6ZVL8 140 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 TSPAN33Q86UF1 283 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 HEATR4Q86WZ0 1026 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 BBS5Q8N3I7 341 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-206ENST00000446904 NSMCE1Q8WV22 266 aa10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms