RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 FATE1Q969F0 183 aa6.69□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.69□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 BRD9Q9H8M2 597 aa6.69□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa6.69□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 SETD4Q9NVD3 440 aa6.69□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ETAA1Q9NY74 926 aa6.69□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 SEC14L3Q9UDX4 400 aa6.69□□□□□ -1.34
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USP46-201ENST00000441222 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ADH1AP07327 375 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PKNOX1P55347 436 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PPP3R1P63098 170 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 LAPTM5Q13571 262 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP46-201ENST00000441222 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP46-201ENST00000441222 MCFD2Q8NI22 146 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP46-201ENST00000441222 C12orf66Q96MD2 445 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP46-201ENST00000441222 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CALML5Q9NZT1 146 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MCM8Q9UJA3 840 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MBD5Q9P267 1494 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 SMCO3A2RU48 225 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PER2O15055 1255 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TIPRLO75663 272 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 SLC22A3O75751 556 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CTDNEP1O95476 244 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ITPKBP27987 946 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP46-201ENST00000441222 PPP2R2BQ00005 443 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ZFP69Q49AA0 526 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 C17orf64Q86WR6 236 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 XPR1Q9UBH6 696 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CLDN4O14493 209 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 RECQL4O94761 1208 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ZNF432O94892 652 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 HDCP19113 662 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 HTR7P34969 479 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PRR5P85299 388 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PITPNAQ00169 270 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CPTPQ5TA50 214 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TATDN2Q93075 761 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MGME1Q9BQP7 344 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CDH7Q9ULB5 785 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MADDQ8WXG6 1647 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 RIIAD1A6NNX1 92 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ISM1B1AKI9 464 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 IL1BP01584 269 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CYP1A2P05177 515 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ATF6P18850 670 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 FBXL16Q8N461 479 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 COL6A2P12110 1019 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP46-201ENST00000441222 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TMEM199Q8N511 208 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 RNF148Q8N7C7 305 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 RTKNQ9BST9 563 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 VSTM5A8MXK1 200 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 LAMP2P13473 410 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 KCNA5P22460 613 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 AKR1D1P51857 326 aa6.68□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 SLC12A3P55017 1021 aa6.68□□□□□ -1.34
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