RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 NMRAL1Q9HBL8 299 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 BATF3Q9NR55 127 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 CACNG4Q9UBN1 327 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 F5P12259 2224 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1W2PQH9 124 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 F5H5T6 163 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 F8W8V4 182 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 TNFRSF10BO14763 440 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 AXIN1O15169 862 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAFKO60675 156 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAMP2O60895 175 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 USP12O75317 370 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 KITP10721 976 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 PGM1P36871 562 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 ETFBP38117 255 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 CXCL12P48061 93 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 COPAP53621 1224 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAB10P61026 200 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 NAA20P61599 178 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 AP2B1P63010 937 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 POU4F1Q01851 419 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRKAA1Q13131 559 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 SEPT6Q14141 434 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF235Q14590 738 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC14A2Q15849 920 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 MUM1Q2TAK8 710 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 MARC1Q5VT66 337 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZYG11AQ6WRX3 759 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM13CQ8NE31 585 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 USP33Q8TEY7 942 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 IFT43Q96FT9 208 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAR2Q96K12 515 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 SCYL1Q96KG9 808 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPATA17Q96L03 361 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 NMUR2Q9GZQ4 415 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCNK13Q9HB14 408 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM30AQ9NV96 361 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 ACOT9Q9Y305 439 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SDK1Q7Z5N4 2213 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 HMX2A2RU54 273 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 K7ESF4 209 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAN2B1O00754 1011 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCL16O15467 120 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 DIAPH2O60879 1101 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SIN3BO75182 1162 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 FKBP6O75344 327 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ECI2O75521 394 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANP32DO95626 131 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 FGF1P05230 155 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 HLA-DQB2P05538 268 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 C2P06681 752 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms