RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TOP3B-206ENST00000436282 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
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TOP3B-206ENST00000436282 C19orf60Q96EN9 201 aa14.95□□□□□ -0.02
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TOP3B-206ENST00000436282 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.95□□□□□ -0.02
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