RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430445.1

RAB17-208, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, human

TSL 5

Gene RAB17, Length 421 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB17-208	ENST00000430445	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RAB17-208	ENST00000430445	TPI1	P60174	286 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB17-208	ENST00000430445	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RAB17-208	ENST00000430445	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
RAB17-208	ENST00000430445	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
RAB17-208	ENST00000430445	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB17-208	ENST00000430445	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB17-208	ENST00000430445	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB17-208	ENST00000430445	PATE1	Q8WXA2	126 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB17-208	ENST00000430445	ART4	Q93070	314 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB17-208	ENST00000430445	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB17-208	ENST00000430445	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RAB17-208	ENST00000430445	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RAB17-208	ENST00000430445	DONSON	Q9NYP3	566 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB17-208	ENST00000430445	NBAS	A2RRP1	2371 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	RAD1	O60671	282 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	PALM	O75781	387 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	CALB1	P05937	261 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	CEACAM5	P06731	702 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	SOX5	P35711	763 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	CASR	P41180	1078 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	CCR10	P46092	362 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	GNPDA1	P46926	289 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	AIF1	P55008	147 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	FOXK1	P85037	733 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	BIRC2	Q13490	618 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	BECN1	Q14457	450 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	IGFBP7	Q16270	282 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	NAGS	Q8N159	534 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	NUS1	Q96E22	293 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	COQ10A	Q96MF6	247 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	CATSPER2	Q96P56	530 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	DDA1	Q9BW61	102 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	TEX101	Q9BY14	249 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	ANKRD62	A6NC57	917 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	PPM1D	O15297	605 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	THRA	P10827	490 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	GP1BB	P13224	206 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	MPST	P25325	297 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	CSF2RB	P32927	897 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	HTR7	P34969	479 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	KLK7	P49862	253 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	JAM2	P57087	298 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	SQSTM1	Q13501	440 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	MCEE	Q96PE7	176 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	CNPY3	Q9BT09	278 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	VPS16	Q9H269	839 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	SP110	Q9HB58	689 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	SUFU	Q9UMX1	484 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	NKX2-8	O15522	239 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	CR2	P20023	1033 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	SCNN1B	P51168	640 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	AP1S1	P61966	158 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	CTBS	Q01459	385 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	CNGA3	Q16281	694 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	MON1B	Q7L1V2	547 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	FAM129C	Q86XR2	697 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		13.75	□□□□□ -0.21

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