RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHF21BQ96EK2 531 aa18.73■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CATSPER2Q96P56 530 aa18.73■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MUC3BQ9H195 1237 aa18.73■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa18.73■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RGSL1A5PLK6 1076 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SDHDO14521 159 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDE5AO76074 875 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VEPH1Q14D04 833 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM60Q495X7 471 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPM1LQ5SGD2 360 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNKSR3Q6P9H4 555 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLCD3Q8N3E9 789 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTERQ96BW5 349 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF208Q9H0X6 261 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDHA1P08559 390 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRSS56P0CW18 603 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD1DP15813 335 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CES1P23141 567 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PMLP29590 882 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARF5P84085 180 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MUM1Q2TAK8 710 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CUZD1Q86UP6 607 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MDGA1Q8NFP4 955 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4K2Q8NGD2 314 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJC9Q8WXX5 260 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VWCEQ96DN2 955 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM169Q96HH4 297 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF333Q96JL9 665 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAR2Q96K12 515 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POPDC3Q9HBV1 291 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMPD4Q9NXE4 827 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa18.72■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1RP00736 705 aa18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PENKP01210 267 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 F11P03951 625 aa18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IMPDH1P20839 514 aa18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP6V1C1P21283 382 aa18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AP2B1P63010 937 aa18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SATB1Q01826 763 aa18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TWF1Q12792 350 aa18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC39A11Q8N1S5 342 aa18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 L3HYPDHQ96EM0 354 aa18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MARK4Q96L34 752 aa18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSTO2Q9H4Y5 243 aa18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBTB26Q9HCK0 441 aa18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STOML2Q9UJZ1 356 aa18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FIS1Q9Y3D6 152 aa18.71■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRRG1O14668 218 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANPEPP15144 967 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP3CCP48454 512 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUDT2P50583 147 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NFKB2Q00653 900 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AFTPHQ6ULP2 937 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM150AQ86TG1 271 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HERC6Q8IVU3 1022 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LPCAT1Q8NF37 534 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEP70Q8NHQ1 597 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF558Q96NG5 402 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOX2Q96NM4 488 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMIM14Q96QK8 99 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAI2Q9Y5P3 530 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AIM2O14862 343 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FKBP6O75344 327 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD160O95971 181 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCL5P13501 91 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSMA3P25788 255 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTTPP55157 894 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB33AQ14088 237 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HERC3Q15034 1050 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF678Q5SXM1 525 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINGO4Q6UY18 593 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HPS6Q86YV9 775 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXW8Q8N3Y1 598 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GBF1Q92538 1859 aa18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms