RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 APOL2Q9BQE5 337 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 ZNF711Q9Y462 761 aa20.62■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 A0A0U1RQS6 177 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 WNT9AO14904 365 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 RAD51BO15315 384 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 USP12O75317 370 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 APRTP07741 180 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 PIRTP0C851 137 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 CD38P28907 300 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 BASP1P80723 227 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 OVGP1Q12889 678 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 OLIG2Q13516 323 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 LRRC14Q15048 493 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 PPP1R7Q15435 360 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 TEAD4Q15561 434 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 Q6ZVL8 140 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 IQCHQ86VS3 1027 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 NLRP8Q86W28 1048 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 MFSD2AQ8NA29 543 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 SKA1Q96BD8 255 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 SLC6A18Q96N87 628 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 GPR63Q9BZJ6 419 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 SLC6A14Q9UN76 642 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 CACNA1EQ15878 2313 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 A0A1W2PR77 199 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 RGSL1A5PLK6 1076 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 FPGTO14772 594 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 C1SP09871 688 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 DR1Q01658 176 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 PTK6Q13882 451 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 WSCD2Q2TBF2 565 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 DENND2CQ68D51 928 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 DTD2Q96FN9 168 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 BMFQ96LC9 184 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 FZD3Q9NPG1 666 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 RAD18Q9NS91 495 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 PKD2L2Q9NZM6 624 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 SHOC2Q9UQ13 582 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 TOR1BO14657 336 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 VILLO15195 856 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 MAGEC1O60732 1142 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 TPSB2P20231 275 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 HMGCLP35914 325 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 ETV3P41162 512 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 MAGEA6P43360 314 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 SPINT3P49223 89 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 VPS41P49754 854 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 CDH17Q12864 832 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 TPSAB1Q15661 275 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 CSRP2Q16527 193 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 TRIM61Q5EBN2 209 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 ZNF765Q7L2R6 523 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 EID2BQ96D98 161 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 NUS1Q96E22 293 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 KRT12Q99456 494 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 MYOCQ99972 504 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 CAPN10Q9HC96 672 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 GPR179Q6PRD1 2367 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa20.59■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 POM121BA6NF01 834 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 A6NNZ2 444 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 PATE3B3GLJ2 98 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 AP3B1O00203 1094 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 WNT1P04628 370 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 CFIP05156 583 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 IGFALSP35858 605 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 DPTQ07507 201 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 SPEM2Q0P670 501 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 IRF4Q15306 451 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 CCDC6Q16204 474 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-211ENST00000424766 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms