RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414879.5

PTPRF-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 2

Gene PTPRF, Length 4,836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-205	ENST00000414879	PDGFRL	Q15198	375 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	FUK	Q8N0W3	1084 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	GPR152	Q8TDT2	470 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	BORCS6	Q96GS4	357 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	MYH1	P12882	1939 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	ADAMTS3	O15072	1205 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	HGF	P14210	728 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	AMD1	P17707	334 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	S100A5	P33763	92 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	HSD17B2	P37059	387 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	ERVK-21	P61565	698 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	CRADD	P78560	199 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	USP7	Q93009	1102 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	PHF21A	Q96BD5	680 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	SPATA17	Q96L03	361 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	C8orf4	Q9NR00	106 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	RNF186	Q9NXI6	227 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	CCDC189	A1A4V9	331 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	DCX	O43602	365 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	AOC2	O75106	756 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	TNNI3	P19429	210 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	IDS	P22304	550 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	MORN1	Q5T089	497 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	MUC13	Q9H3R2	512 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	LATS1	O95835	1130 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	VAC14	Q08AM6	782 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	ZBTB2	Q8N680	514 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	AVL9	Q8NBF6	648 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	HMCES	Q96FZ2	354 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	C1orf74	Q96LT6	269 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	PDE9A	O76083	593 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	C8G	P07360	202 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	PFKL	P17858	780 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	ASMT	P46597	345 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC34A1	Q06495	639 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	RING1	Q06587	406 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	C16orf46	Q6P387	395 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	CHSY3	Q70JA7	882 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	PLD3	Q8IV08	490 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	THAP11	Q96EK4	314 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	SH3GL2	Q99962	352 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	FSBP	O95073	299 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF682	O95780	498 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	ITGA2	P17301	1181 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	ALDH9A1	P49189	494 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	CTBP1	Q13363	440 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	C16orf87	Q6PH81	154 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	CCNF	P41002	786 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	NSG1	P42857	185 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	PROX1	Q92786	737 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	KRT84	Q9NSB2	600 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRF-205	ENST00000414879	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5

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