RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413522.1

SNORD56-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56-201ENST00000413522 TGFB3P10600 412 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 CHMP24386 653 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 F2RL1P55085 397 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 TUBA1BP68363 451 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 KEAP1Q14145 624 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 NFATC4Q14934 902 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 SLC39A14Q15043 492 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 MED22Q15528 200 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 ASIC2Q16515 512 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 CALCRLQ16602 461 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 FAM69BQ5VUD6 431 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 CCDC30Q5VVM6 783 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 GGNBP1Q5YKI7 109 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 SIGIRRQ6IA17 410 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 WDR73Q6P4I2 378 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 RHBDF2Q6PJF5 856 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 SLC36A4Q6YBV0 504 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 ADHFE1Q8IWW8 467 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 PDILTQ8N807 584 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 FRMD1Q8N878 549 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 TMEM116Q8NCL8 245 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 NEK9Q8TD19 979 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 SKA1Q96BD8 255 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 RTP4Q96DX8 246 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 PERPQ96FX8 193 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 SCMH1Q96GD3 660 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 SLC41A2Q96JW4 573 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 C3orf30Q96M34 536 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 TMEM68Q96MH6 324 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 MAP7D2Q96T17 732 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 TMEM47Q9BQJ4 181 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 HAUS8Q9BT25 410 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 STRA6Q9BX79 667 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 SLC28A3Q9HAS3 691 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 SCPEP1Q9HB40 452 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 KRT84Q9NSB2 600 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 PSAT1Q9Y617 370 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 A0A087X0M5 115 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 A0A1B0GX30 115 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 A0A1W2PRG0 241 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 CPED1A4D0V7 1026 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 C4orf47A7E2U8 309 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 PROB1E7EW31 1015 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 VCYO14598 125 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 ACOT8O14734 319 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 PAGE4O60829 102 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 GAGE7O76087 117 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 CLDN14O95500 239 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 MLYCDO95822 493 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 GAGE12FP0CL80 117 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 GAGE12GP0CL81 117 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 GAGE12IP0CL82 117 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 DDX5P17844 614 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 MAOAP21397 527 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 ARL3P36405 182 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 ART1P52961 327 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 RAD23BP54727 409 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 GAGE1Q13065 139 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 GAGE4Q13068 117 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP2.76□□□□□ -1.973e-26■■□□□ 11.9
SNORD56-201ENST00000413522 CTF1Q16619 201 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 TTI2Q6NXR4 508 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 CYP20A1Q6UW02 462 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 DLK2Q6UY11 383 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 KRBA2Q6ZNG9 492 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 PQLC2Q6ZP29 291 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 PXKQ7Z7A4 578 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 ZNF114Q8NC26 417 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 ADGRG7Q96K78 797 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56-201ENST00000413522 HARBI1Q96MB7 349 aa2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms