RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 KLHL5Q96PQ7 755 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PKMYT1Q99640 499 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM79Q9BSE2 394 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 COQ10BQ9H8M1 238 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CDC14AQ9UNH5 594 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TLL2Q9Y6L7 1015 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 SQORQ9Y6N5 450 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 F8W810 466 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PLOD2O00469 737 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CCL22O00626 93 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM38O00635 465 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 UBDO15205 165 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CSPG5O95196 566 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CAPNS1P04632 268 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CYP11A1P05108 521 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ITGB1P05556 798 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 OR4Q2P0C623 313 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 KRT80Q6KB66 452 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 KIAA0408Q6ZU52 694 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 BEND5Q7L4P6 421 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CUZD1Q86UP6 607 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CARM1Q86X55 608 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 MYO1HQ8N1T3 1032 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 STON2Q8WXE9 905 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 DLG3Q92796 817 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC126Q96EE4 140 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TSPAN17Q96FV3 270 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 FAR2Q96K12 515 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 NEURL2Q9BR09 285 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 SLC25A51Q9H1U9 297 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 NMUR1Q9HB89 426 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC167Q9P0B6 97 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PADI3Q9ULW8 664 aa13.21□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 MGEA5O60502 916 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 MT-CO1P00395 513 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 RBP1P09455 135 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 TSPAN8P19075 237 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 HDCP19113 662 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 THPOP40225 353 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 RENBPP51606 427 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 CLCN5P51795 746 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 STX5Q13190 355 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 PPP1R3AQ16821 1122 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 HECTD2Q5U5R9 776 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 SDHAF4Q5VUM1 108 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 IL23RQ5VWK5 629 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 KDELC1Q6UW63 502 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 CD300LGQ6UXG3 332 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 GPR141Q7Z602 305 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 CENPSQ8N2Z9 138 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 SNX31Q8N9S9 440 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 TTC3P53804 2025 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 J3KR12 359 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ACOT8O14734 319 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 CELF2O95319 508 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 GSTT2P0CG29 244 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 GSTT2BP0CG30 244 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 C1QTNF8P60827 252 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 CD300CQ08708 224 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 MARC1Q5VT66 337 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 LAYNQ6UX15 382 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 XKR5Q6UX68 686 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 PELI3Q8N2H9 469 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 FIBCD1Q8N539 461 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 BORCS5Q969J3 196 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ATP6V1E2Q96A05 226 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 PLEKHA8Q96JA3 519 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF597Q96LX8 424 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 SYT17Q9BSW7 474 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 PCDHAC1Q9H158 963 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 VWA7Q9Y334 891 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 TMED5Q9Y3A6 229 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM17Q9Y577 477 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 TANC1Q9C0D5 1861 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 BPTFQ12830 3046 aa13.2□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 E7ENX8 843 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 M0QZQ0 153 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 ATE1O95260 518 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 SLC4A1P02730 911 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 AKR1A1P14550 325 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 HMOX2P30519 316 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 PRAMEP78395 509 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 DSC2Q02487 901 aa13.19□□□□□ -0.3
TMOD1-202ENST00000375175 SLC10A7Q0GE19 358 aa13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms