RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375023.3

NOTCH4-201, Transcript of notch 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOTCH4, Length 6,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4-201ENST00000375023 TRIM39Q9HCM9 518 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GMIPQ9P107 970 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 RCCD1A6NED2 376 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CCNA2P20248 432 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 WARSP23381 471 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PDHA2P29803 388 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ICAM3P32942 547 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CYP4F8P98187 520 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SMU1Q2TAY7 513 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 MTX3Q5HYI7 312 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ULK2Q8IYT8 1036 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 MATN4O95460 622 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ETS2P15036 469 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ALDH4A1P30038 563 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 OMPP47874 163 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 P4HA3Q7Z4N8 544 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 OR4L1Q8NH43 312 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 JOSD2Q8TAC2 188 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 UBAP1Q9NZ09 502 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CHADO15335 359 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 MC1RQ01726 317 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SCLYQ96I15 445 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 OR2AG2A6NM03 316 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 RFXANKO14593 260 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CYP3A4P08684 503 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 TTPAP49638 278 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PCDH1Q08174 1060 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GPR107Q5VW38 600 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 IRGCQ6NXR0 463 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 LNX2Q8N448 690 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 HAS1Q92839 578 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 TTLL2Q9BWV7 592 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PEX6Q13608 980 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 KCT2Q8NC54 265 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CHRNGP07510 517 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CEBPGP53567 150 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CAMK1Q14012 370 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 LDAHQ9H6V9 325 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 NMUR1Q9HB89 426 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SNX15Q9NRS6 342 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 LGR5O75473 907 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 FTH1P02794 183 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 EPHX1P07099 455 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SKP1P63208 163 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 FCRL4Q96PJ5 515 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CA14Q9ULX7 337 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 RPTORQ8N122 1335 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 MSCO60682 206 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 KCNJ2P63252 427 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 TSSK3Q96PN8 268 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ALG2Q9H553 416 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ABCB9Q9NP78 766 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 TIMM22Q9Y584 194 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ENTPD5O75356 428 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PSMD10O75832 226 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SCGNO76038 276 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 DBIP07108 87 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PSME3P61289 254 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 MINDY4Q4G0A6 757 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 KRT74Q7RTS7 529 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CADM2Q8N3J6 435 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC9A6Q92581 669 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 RASSF1Q9NS23 344 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms