RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 RAET1EQ8TD07 263 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TFAP2CQ92754 450 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CASP10Q92851 521 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZUFSPQ96AP4 578 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ROPN1LQ96C74 230 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 RCN3Q96D15 328 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC126Q96EE4 140 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CERS2Q96G23 380 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CPXM1Q96SM3 734 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CGREF1Q99674 301 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CXorf21Q9HAI6 301 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 UGT1A7Q9HAW7 530 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 UGT1A10Q9HAW8 530 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 UGT1A8Q9HAW9 530 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PLAC1Q9HBJ0 212 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 OLAHQ9NV23 265 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ADA2Q9NZK5 511 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PKD2L2Q9NZM6 624 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM216Q9P0N5 145 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TLK1Q9UKI8 766 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 RAD54BQ9Y620 910 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF839A8K0R7 811 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ST8SIA5O15466 376 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CFLARO15519 480 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NPHS1O60500 1241 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 DDHD2O94830 711 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF286BP0CG31 522 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 HOXD12P35452 270 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ASPAP45381 313 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PSME3P61289 254 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 BNIP2Q12982 314 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CAPSQ13938 189 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 GRIK4Q16099 956 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 INAQ16352 499 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PSMD5Q16401 504 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 BCL2A1Q16548 175 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 DPYSL2Q16555 572 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 KYAT1Q16773 422 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CLEC14AQ86T13 490 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TTC30BQ8N4P2 665 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 FIBCD1Q8N539 461 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CD99L2Q8TCZ2 262 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 RAB2BQ8WUD1 216 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 HTR3CQ8WXA8 447 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 S100ZQ8WXG8 99 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TFAP2BQ92481 460 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SEPT8Q92599 483 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MFSD3Q96ES6 412 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SLC45A3Q96JT2 553 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 LPIN3Q9BQK8 851 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CORO1BQ9BR76 489 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A23Q9BV35 468 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 FTHL17Q9BXU8 183 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SELENONQ9NZV5 590 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 KLF15Q9UIH9 416 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 RNF11Q9Y3C5 154 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 EVPLQ92817 2033 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 A0A096LPK6 155 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 C9IYK1 514 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 HAS3O00219 553 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 AREL1O15033 823 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 AXIN1O15169 862 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 AVPP01185 164 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ALDH2P05091 517 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TFEBP19484 476 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CCNA2P20248 432 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 JAK1P23458 1154 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ATP4BP51164 291 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SLC5A3P53794 718 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SOX10P56693 466 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
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