RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PITX3-201ENST00000370002 DTLQ9NZJ0 730 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX3-201ENST00000370002 PADI4Q9UM07 663 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX3-201ENST00000370002 RAXQ9Y2V3 346 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX3-201ENST00000370002 AK5Q9Y6K8 562 aa20.34■□□□□ 0.85
PITX3-201ENST00000370002 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 GJC1P36383 396 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 SEMG2Q02383 582 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 ITKQ08881 620 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 SPTLC3Q9NUV7 552 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 PKD1L2Q7Z442 2459 aa20.33■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 A0A0J9YYE9 177 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 CPED1A4D0V7 1026 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 DXOO77932 396 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 TRBC1P01850 177 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 CLDN6P56747 220 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 GSDMDP57764 484 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 PEX6Q13608 980 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 GUSBP11Q6P575 273 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 OGFOD3Q6PK18 319 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 IGF2-ASQ6U949 168 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 ZNF765Q7L2R6 523 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 LYSMD1Q96S90 227 aa20.32■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 LRRD1A4D1F6 860 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 TMEM202A6NGA9 273 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 LCA5LO95447 670 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 PNLIPP16233 465 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 LHCGRP22888 699 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 ACTN2P35609 894 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 GBE1Q04446 702 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 PLD5Q8N7P1 536 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 CCNYQ8ND76 341 aa20.31■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 A8MX80 341 aa20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 PDHA1P08559 390 aa20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 TGM2P21980 687 aa20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 ETV3P41162 512 aa20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 LSSP48449 732 aa20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 NR2C2P49116 596 aa20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 PDK1Q15118 436 aa20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 ISXQ2M1V0 245 aa20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 ODF2Q5BJF6 829 aa20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 RD3Q7Z3Z2 195 aa20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 GPR156Q8NFN8 814 aa20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 OR1E3Q8WZA6 343 aa20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 FGF11Q92914 225 aa20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 PDXPQ96GD0 296 aa20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 FGF22Q9HCT0 170 aa20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 GPR34Q9UPC5 381 aa20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 LHX6Q9UPM6 363 aa20.3■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 PRSS38A1L453 326 aa20.29■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 APOL1O14791 398 aa20.29■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 MYF5P13349 255 aa20.29■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 EPHB1P54762 984 aa20.29■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 ERVPABLB-1P60509 514 aa20.29■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 SLC14A2Q15849 920 aa20.29■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.29■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 Q6ZVL8 140 aa20.29■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa20.29■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 TC2NQ8N9U0 490 aa20.29■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 LGR4Q9BXB1 951 aa20.29■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.29■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 APPL1Q9UKG1 709 aa20.29■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 LAMA5O15230 3695 aa20.29■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 RGSL1A5PLK6 1076 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 CAPN8A6NHC0 703 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 RRP8O43159 456 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 CSO75390 466 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms