RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 EFNA5P52803 228 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 EIF5P55010 431 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 LTBQ06643 244 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 NIPAL4Q0D2K0 466 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 GPS2Q13227 327 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 NAE1Q13564 534 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 FGFBP1Q14512 234 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 ASIC2Q16515 512 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 CTF1Q16619 201 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 SOWAHAQ2M3V2 549 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 MZT2BQ6NZ67 158 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 CYP20A1Q6UW02 462 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 KRBA2Q6ZNG9 492 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 IQCF1Q8N6M8 205 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 SNAPC3Q92966 411 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 ARHGEF26Q96DR7 871 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 LMLNQ96KR4 655 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 PCGF1Q9BSM1 259 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 NDST4Q9H3R1 872 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 C17orf75Q9HAS0 396 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 GPR108Q9NPR9 543 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 SESN1Q9Y6P5 492 aa2.97□□□□□ -1.93
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 LIPT2A6NK58 231 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 IFITM10A6NMD0 228 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 BECN2A8MW95 431 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 WNT9BO14905 357 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 SCAMP1O15126 338 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 GPC4O75487 556 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 GAGE7O76087 117 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 NKX2-2O95096 273 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 VNN2O95498 520 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 GLUD1P00367 558 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 LCATP04180 440 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 GAGE12FP0CL80 117 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 GAGE12GP0CL81 117 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 GAGE12IP0CL82 117 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 TGFB3P10600 412 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 EDN2P20800 178 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 AGAP20933 346 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 HOXC9P31274 260 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 THPOP40225 353 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 PBX3P40426 434 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 GLUD2P49448 558 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 PCYT1AP49585 367 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 DRG2P55039 364 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 F2RL1P55085 397 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 ACSM2AQ08AH3 577 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 GRIK3Q13003 919 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 GAGE1Q13065 139 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 GAGE4Q13068 117 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 TRAF1Q13077 416 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 PRKG2Q13237 762 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 MYBPC2Q14324 1141 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 NAB2Q15742 525 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 ADIPOQQ15848 244 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 CALCRLQ16602 461 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 COL28A1Q2UY09 1125 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 ACSM2BQ68CK6 577 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 Q6ZTC4 211 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 IKBIPQ70UQ0 350 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC35F3Q8IY50 421 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 AADATQ8N5Z0 425 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 ANKRD52Q8NB46 1076 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 KCNH5Q8NCM2 988 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 ARRDC2Q8TBH0 407 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 MAGEC3Q8TD91 643 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 KCNG4Q8TDN1 519 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 ELP5Q8TE02 316 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 DNAAF4Q8WXU2 420 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 ERGIC1Q969X5 290 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 NUDCD1Q96RS6 583 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM110AQ9BQ89 295 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 SDF4Q9BRK5 362 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 MSTO1Q9BUK6 570 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa2.96□□□□□ -1.94
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC28A3Q9HAS3 691 aa2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms