RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 DPYSL2Q16555 572 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 CARTPTQ16568 116 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 TSTD2Q5T7W7 516 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 SAPCD2Q86UD0 394 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 P2RY11Q96G91 374 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 MTRRQ9UBK8 725 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 TARM1B6A8C7 271 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 DPYSL4O14531 572 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 GPC4O75487 556 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 AXLP30530 894 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 INCA1Q0VD86 236 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 ZNF460Q14592 562 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 LCLAT1Q6UWP7 414 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 DPP9Q86TI2 863 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 RETREG3Q86VR2 466 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 KCNMB4Q86W47 210 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 TTC30BQ8N4P2 665 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 NAT16Q8N8M0 369 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 MYRFLQ96LU7 910 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 MUS81Q96NY9 551 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 FUNDC2Q9BWH2 189 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 OSBPL2Q9H1P3 480 aa16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 AURKAO14965 403 aa16.83■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 UGT2B4P06133 528 aa16.83■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 SLC35E2BP0CK96 405 aa16.83■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 CLCQ05315 142 aa16.83■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 POU5F1BQ06416 359 aa16.83■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa16.83■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 CLEC4CQ8WTT0 213 aa16.83■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 CEP44Q9C0F1 390 aa16.83■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 DPEP3Q9H4B8 488 aa16.83■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa16.83■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 VANGL2Q9ULK5 521 aa16.83■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa16.83■□□□□ 0.29
GDE1-201ENST00000353258 MFSD11O43934 449 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 MT-ND1P03886 318 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 SMPD1P17405 629 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 ATP6V0D1P61421 351 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 CEP350Q5VT06 3117 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 HACD2Q6Y1H2 254 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 TMEM135Q86UB9 458 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 OR6B3Q8NGW1 331 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 FKBP10Q96AY3 582 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 OSMRQ99650 979 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 DGCR6LQ9BY27 220 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 ING2Q9H160 280 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 SNX25Q9H3E2 840 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 RMND5AQ9H871 391 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 VWA7Q9Y334 891 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 ABCB7O75027 752 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 XYLBO75191 536 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 GOT1P17174 413 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 AKAP5P24588 427 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 SHMT2P34897 504 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 NR4A2P43354 598 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 GJA9P57773 515 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 ITIH5Q86UX2 942 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 FAM35AQ86V20 835 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 CLIP4Q8N3C7 705 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 DNAAF3Q8N9W5 541 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 IL12RB2Q99665 862 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 ADNPQ9H2P0 1102 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 CHRAC1Q9NRG0 131 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 TIMM22Q9Y584 194 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 TLL2Q9Y6L7 1015 aa16.83■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 NEMP2A6NFY4 417 aa16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 CHEK2O96017 543 aa16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 CYP51A1Q16850 503 aa16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 ATAD3BQ5T9A4 648 aa16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 CATSPER4Q7RTX7 472 aa16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 SLCO6A1Q86UG4 719 aa16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 SLC22A16Q86VW1 577 aa16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 ZNF567Q8N184 647 aa16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 TRPV3Q8NET8 790 aa16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 OR6J1Q8NGC5 347 aa16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 GPR22Q99680 433 aa16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP16.82■□□□□ 0.284e-11■■□□□ 13.7
GDE1-201ENST00000353258 KLK14Q9P0G3 267 aa16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 PLXNB2O15031 1838 aa16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 ZNF487B1APH4 448 aa16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 GABBR2O75899 941 aa16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 YWHAQP27348 245 aa16.82■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 CCNA1P78396 465 aa16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms