RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 VPS4AQ9UN37 437 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 AP3D1O14617 1153 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PDE9AO76083 593 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PBX3P40426 434 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 OASLQ15646 514 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 TMC5Q6UXY8 1006 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 EXOC3L1Q86VI1 746 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRO-202ENST00000348962 RIBC2Q9H4K1 309 aa15.46■□□□□ 0.07
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PTPRO-202ENST00000348962 RAP2CQ9Y3L5 183 aa15.46■□□□□ 0.07
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PTPRO-202ENST00000348962 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
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PTPRO-202ENST00000348962 FAM25AB3EWG3 89 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 FAM25CB3EWG5 89 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 FAM25GB3EWG6 89 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 HK2P52789 917 aa15.45■□□□□ 0.06
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PTPRO-202ENST00000348962 PMF1Q6P1K2 205 aa15.45■□□□□ 0.06
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PTPRO-202ENST00000348962 NMUR1Q9HB89 426 aa15.45■□□□□ 0.06
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PTPRO-202ENST00000348962 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CASZ1Q86V15 1759 aa15.45■□□□□ 0.06
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PTPRO-202ENST00000348962 BMP7P18075 431 aa15.45■□□□□ 0.06
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PTPRO-202ENST00000348962 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
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PTPRO-202ENST00000348962 LIPMQ5VYY2 423 aa15.45■□□□□ 0.06
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PTPRO-202ENST00000348962 EPS8Q12929 822 aa15.45■□□□□ 0.06
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PTPRO-202ENST00000348962 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.45■□□□□ 0.06
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PTPRO-202ENST00000348962 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa15.45■□□□□ 0.06
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PTPRO-202ENST00000348962 WASHC2DQ5SRD0 308 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 IZUMO2Q6UXV1 221 aa15.44■□□□□ 0.06
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PTPRO-202ENST00000348962 LRRN4Q8WUT4 740 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 DLG3Q92796 817 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF607Q96SK3 696 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 SLC25A51Q9H1U9 297 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 DNAJC11Q9NVH1 559 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 ALOX15BO15296 676 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRO-202ENST00000348962 LRIG2O94898 1065 aa15.44■□□□□ 0.06
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