RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340006.6

CSRP1-201, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSRP1, Length 1,952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1-201ENST00000340006 STX7O15400 261 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
CSRP1-201ENST00000340006 ELFN1P0C7U0 828 aa14.77□□□□□ -0.04
CSRP1-201ENST00000340006 PTSQ03393 145 aa14.77□□□□□ -0.04
CSRP1-201ENST00000340006 KYNUQ16719 465 aa14.77□□□□□ -0.04
CSRP1-201ENST00000340006 LRRC66Q68CR7 880 aa14.77□□□□□ -0.04
CSRP1-201ENST00000340006 USP30Q70CQ3 517 aa14.77□□□□□ -0.04
CSRP1-201ENST00000340006 NLRP9Q7RTR0 991 aa14.77□□□□□ -0.04
CSRP1-201ENST00000340006 RELL1Q8IUW5 271 aa14.77□□□□□ -0.04
CSRP1-201ENST00000340006 CCNJLQ8IV13 435 aa14.77□□□□□ -0.04
CSRP1-201ENST00000340006 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.77□□□□□ -0.04
CSRP1-201ENST00000340006 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.77□□□□□ -0.04
CSRP1-201ENST00000340006 ZBTB9Q96C00 473 aa14.77□□□□□ -0.04
CSRP1-201ENST00000340006 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
CSRP1-201ENST00000340006 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.77□□□□□ -0.04
CSRP1-201ENST00000340006 EBF1Q9UH73 591 aa14.77□□□□□ -0.04
CSRP1-201ENST00000340006 GGT7Q9UJ14 662 aa14.77□□□□□ -0.04
CSRP1-201ENST00000340006 SOX13Q9UN79 622 aa14.77□□□□□ -0.04
CSRP1-201ENST00000340006 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
CSRP1-201ENST00000340006 TCAF1Q9Y4C2 921 aa14.77□□□□□ -0.04
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CSRP1-201ENST00000340006 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
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CSRP1-201ENST00000340006 PTPRCAPQ14761 206 aa14.76□□□□□ -0.05
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CSRP1-201ENST00000340006 BTBD1Q9H0C5 482 aa14.76□□□□□ -0.05
CSRP1-201ENST00000340006 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.76□□□□□ -0.05
CSRP1-201ENST00000340006 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.76□□□□□ -0.05
CSRP1-201ENST00000340006 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.76□□□□□ -0.05
CSRP1-201ENST00000340006 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
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CSRP1-201ENST00000340006 AREL1O15033 823 aa14.76□□□□□ -0.05
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CSRP1-201ENST00000340006 ZNF217O75362 1048 aa14.76□□□□□ -0.05
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CSRP1-201ENST00000340006 ZIM3Q96PE6 472 aa14.76□□□□□ -0.05
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CSRP1-201ENST00000340006 SSTR1P30872 391 aa14.74□□□□□ -0.05
CSRP1-201ENST00000340006 ACSL1P33121 698 aa14.74□□□□□ -0.05
CSRP1-201ENST00000340006 HADHAP40939 763 aa14.74□□□□□ -0.05
CSRP1-201ENST00000340006 PRAMEP78395 509 aa14.74□□□□□ -0.05
CSRP1-201ENST00000340006 TMEM52BQ4KMG9 183 aa14.74□□□□□ -0.05
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