RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF678Q5SXM1 525 aa18.38■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 MIER2Q8N344 545 aa18.38■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 L3HYPDHQ96EM0 354 aa18.38■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa18.38■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 PALMDQ9NP74 551 aa18.38■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 PFDN4Q9NQP4 134 aa18.38■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 GID8Q9NWU2 228 aa18.38■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 CMTM6Q9NX76 183 aa18.38■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 BPTFQ12830 3046 aa18.38■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 DYTNA2CJ06 578 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 NFKBIEO00221 500 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 PMPCBO75439 489 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 FAM163BP0C2L3 166 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 USP17L7P0C7H9 530 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 IDO1P14902 403 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 SLC6A2P23975 617 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 CXCR3P49682 368 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 NEDD8Q15843 81 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 CYP51A1Q16850 503 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 PM20D1Q6GTS8 502 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 CLYBLQ8N0X4 340 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 CALML6Q8TD86 181 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 TMEM165Q9HC07 324 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 SPON1Q9HCB6 807 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 ASB14A6NK59 587 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 CHRNA4P43681 627 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 RPS9P46781 194 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 SLC14A2Q15849 920 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 UGT3A2Q3SY77 523 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 SPATS1Q496A3 300 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 GRAMD4Q6IC98 578 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 NANOGP8Q6NSW7 305 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 FAM117BQ6P1L5 589 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 ANKRD49Q8WVL7 239 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 ALG9Q9H6U8 611 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 SELENONQ9NZV5 590 aa18.37■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 RFC2P35250 354 aa18.36■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP18.36■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 OGFOD2Q6N063 350 aa18.36■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa18.36■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 CENPSQ8N2Z9 138 aa18.36■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 TRPM4Q8TD43 1214 aa18.36■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 EDEM1Q92611 657 aa18.36■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 LRRC58Q96CX6 371 aa18.36■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 IL12RB2Q99665 862 aa18.36■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 CCDC68Q9H2F9 335 aa18.36■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 ATXN3LQ9H3M9 355 aa18.36■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 DOLKQ9UPQ8 538 aa18.36■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa18.36■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 INPP4BO15327 924 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 SERPINB7O75635 380 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 HLCSP50747 726 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 BMXP51813 675 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 NFATC3Q12968 1075 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 HECTD2Q5U5R9 776 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 KDELC2Q7Z4H8 507 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 CHPT1Q8WUD6 406 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 TANKQ92844 425 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 MUC13Q9H3R2 512 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 GNPTGQ9UJJ9 305 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF236Q9UL36 1845 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 BAIAP3O94812 1187 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 KCNE1P15382 129 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 CCNA2P20248 432 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 BCAP31P51572 246 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 HERVK_113P63132 956 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 FOXM1Q08050 763 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 UNC50Q53HI1 259 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 WSCD1Q658N2 575 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 FAM35AQ86V20 835 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 RNF34Q969K3 372 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 ACDQ96AP0 544 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 ERVK-6Q9BXR3 956 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 RBPJLQ9UBG7 517 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 WDR37Q9Y2I8 494 aa18.35■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 SOBPA7XYQ1 873 aa18.34■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 K7EPI3 171 aa18.34■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 ESRRBO95718 433 aa18.34■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 CPNE6O95741 557 aa18.34■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 TMBIM6P55061 237 aa18.34■□□□□ 0.53
LRRC25-201ENST00000339007 TNK2Q07912 1038 aa18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms