RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 PIGVQ9NUD9 493 aa20.29■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 CAPN3P20807 821 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 ELK4P28324 431 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 IDUAP35475 653 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 RNF135Q8IUD6 432 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 STARD8Q92502 1023 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRC58Q96CX6 371 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 PHF21BQ96EK2 531 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 ING2Q9H160 280 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 VWA7Q9Y334 891 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 TCRBV5S2A0A599 114 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 KCNH1O95259 989 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 PAMP19021 973 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 ADRA1BP35368 520 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 HCAR3P49019 387 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 POU6F1Q14863 301 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 PIGZQ86VD9 579 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 PPP1R16BQ96T49 567 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC9A7Q96T83 725 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 CSF3RQ99062 836 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM54Q9BYV2 358 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 AKTIPQ9H8T0 292 aa20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 TSC2P49815 1807 aa20.27■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 SOWAHBA6NEL2 793 aa20.27■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 JCHAINP01591 159 aa20.27■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 IMPDH1P20839 514 aa20.27■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 ARNTP27540 789 aa20.27■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 GSTM2P28161 218 aa20.27■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 AXLP30530 894 aa20.27■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 SEMA3BQ13214 749 aa20.27■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 Q3C1V9 767 aa20.27■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 COQ5Q5HYK3 327 aa20.27■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM35AQ86V20 835 aa20.27■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 NTAN1Q96AB6 310 aa20.27■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 C3orf30Q96M34 536 aa20.27■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa20.27■□□□□ 0.84
PPP1CC-201ENST00000335007 C22orf31O95567 290 aa20.27■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 DEPDC1Q5TB30 811 aa20.27■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa20.27■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 PARP8Q8N3A8 854 aa20.27■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 MUS81Q96NY9 551 aa20.27■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.27■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 DERAQ9Y315 318 aa20.27■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa20.27■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 CAPN15O75808 1086 aa20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 ARIH2O95376 493 aa20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 HPCAL1P37235 193 aa20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 LAMC2Q13753 1193 aa20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 ACAP2Q15057 778 aa20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF280DQ6N043 979 aa20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 BDH2Q9BUT1 245 aa20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 ALG2Q9H553 416 aa20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 B4GAT1O43505 415 aa20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 MATN4O95460 622 aa20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 PLA2G16P53816 162 aa20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 SCAPQ12770 1279 aa20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 MYLKQ15746 1914 aa20.25■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 C16orf96A6NNT2 1141 aa20.25■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 SUPT7LO94864 414 aa20.25■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 GSK3BP49841 420 aa20.25■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa20.25■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.25■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 DCAF15Q66K64 600 aa20.25■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.25■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.25■□□□□ 0.83
PPP1CC-201ENST00000335007 CLYBLQ8N0X4 340 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms