RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa19.19■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 BPIFB1Q8TDL5 484 aa19.19■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 KCTD4Q8WVF5 259 aa19.19■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 SMARCD2Q92925 531 aa19.19■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 VOPP1Q96AW1 172 aa19.19■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 OLFM1Q99784 485 aa19.19■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 GPR63Q9BZJ6 419 aa19.19■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 BPIFA1Q9NP55 256 aa19.19■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 A0A087X1B8 175 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 A0A0J9YYE9 177 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 DNAJC6O75061 913 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 TRBC1P01850 177 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 PRSS56P0CW18 603 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 ADH5P11766 374 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 STC1P52823 247 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 STX3Q13277 289 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 GEN1Q17RS7 908 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 TYSND1Q2T9J0 566 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 CARD16Q5EG05 197 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 GPR149Q86SP6 731 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 TSPAN17Q96FV3 270 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 C7orf26Q96N11 449 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 NPHS2Q9NP85 383 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 FKBPLQ9UIM3 349 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 CDH22Q9UJ99 828 aa19.18■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 CCT8L1PA6NM43 557 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 TGDSO95455 350 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 ADH1CP00326 375 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 APOA4P06727 396 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 BMP1P13497 986 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 HMGCLP35914 325 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 TCEAL5Q5H9L2 206 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 EID2BQ96D98 161 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 ASIC4Q96FT7 647 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 GDE1Q9NZC3 331 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 IL17CQ9P0M4 197 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 PKP3Q9Y446 797 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 G3V2L1 256 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 H7C0S8 307 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 SNNO75324 88 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 KLHL2O95198 593 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 POP4O95707 220 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 MC4RP32245 332 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 OCRLQ01968 901 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 FAM45BPQ6NSW5 357 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 ZNF549Q6P9A3 640 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 CCDC121Q6ZUS5 278 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 TMEM151AQ8N4L1 468 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 TTC8Q8TAM2 541 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 FAM45AQ8TCE6 357 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 MYLIPQ8WY64 445 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 CCT6BQ92526 530 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 NXNL1Q96CM4 212 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 ERVW-1Q9UQF0 538 aa19.17■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 C5orf42Q9H799 3197 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 CISD3P0C7P0 127 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 HNF1BP35680 557 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 GLRBP48167 497 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 DGKGP49619 791 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 CDKN2DP55273 166 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 DLG1Q12959 904 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 PEX6Q13608 980 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 Q6ZVU0 165 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 ZSWIM9Q86XI8 627 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 SPATA6LQ8N4H0 392 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 SCYL1Q96KG9 808 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 GPR78Q96P69 363 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 TCF12Q99081 682 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 TRIM55Q9BYV6 548 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 SUV39H2Q9H5I1 410 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 GPAMQ9HCL2 828 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 THAP1Q9NVV9 213 aa19.16■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 LINC01565O15544 149 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 RALBP11234 206 aa19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
UPP1-201ENST00000331803 RAD51Q06609 339 aa19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms