RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 SCINQ9Y6U3 715 aa25.08■■□□□ 1.61
PPP4R4-202ENST00000328839 B8ZZF3 427 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 ARL4AP40617 200 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 MAPK10P53779 464 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 CNGA3Q16281 694 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 SMTNL2Q2TAL5 461 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 USP53Q70EK8 1073 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 HEATR4Q86WZ0 1026 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 HSPH1Q92598 858 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 COQ10AQ96MF6 247 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 CMKLR1Q99788 373 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 GOLGA6L22H0YM25 854 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 NVLO15381 856 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 EFSO43281 561 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 PRAMEF10O60809 474 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 LIPCP11150 499 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 GZMAP12544 262 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 NFKBIAP25963 317 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 VIPR1P32241 457 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 MAZP56270 477 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 TYRO3Q06418 890 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 AMZ1Q400G9 498 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 TMCO3Q6UWJ1 677 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 BBS5Q8N3I7 341 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM159Q96B96 161 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 SEPT10Q9P0V9 454 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 ACSL6Q9UKU0 697 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 A0A1W2PQ67 120 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 RHPN2P1A8MT19 583 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 SOCS5O75159 536 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 CCNB1P14635 433 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 AMPD1P23109 780 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 ETV5P41161 510 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 ETV3P41162 512 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 GNPDA1P46926 289 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 KLHL30Q0D2K2 578 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 BIRC2Q13490 618 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 NUDCD1Q96RS6 583 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 GSDMCQ9BYG8 508 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 SEMA6CQ9H3T2 930 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 RDH14Q9HBH5 336 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 ETNK2Q9NVF9 386 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.65e-8■□□□□ 8.8
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PPP4R4-202ENST00000328839 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 ALDH4A1P30038 563 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 MAXP61244 160 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 FILIP1LQ4L180 1135 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 MANEAQ5SRI9 462 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 RAET1GQ6H3X3 334 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 PIM3Q86V86 326 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 ZFAND4Q86XD8 727 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 SLITRK4Q8IW52 837 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 PGBD5Q8N414 524 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 ATPAF2Q8N5M1 289 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 GPBAR1Q8TDU6 330 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 NSMCE1Q8WV22 266 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 USP7Q93009 1102 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 TRIM11Q96F44 468 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 NOD2Q9HC29 1040 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 KCTD5Q9NXV2 234 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 CEACAM5P06731 702 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 SKILP12757 684 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 TCF4P15884 667 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 AK4P27144 223 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 IL1R2P27930 398 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 PCK1P35558 622 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 OR1D5P58170 312 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 B4GALNT1Q00973 533 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 TRAF2Q12933 501 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 DPYSL2Q16555 572 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC30A9Q6PML9 568 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 VASH2Q86V25 355 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 SGF29Q96ES7 293 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 DTD2Q96FN9 168 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4R4-202ENST00000328839 TEX101Q9BY14 249 aa25.03■■□□□ 1.6
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