RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 LPCAT1Q8NF37 534 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 LMX1AQ8TE12 382 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 HAUS1Q96CS2 278 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBATAQ96M53 351 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR92Q96MX6 357 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGAP3Q96P47 875 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 HERPUD2Q9BSE4 406 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDH9Q9HC56 1237 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPASTQ9UBP0 616 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 MACROD2A1Z1Q3 448 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEMP2A6NFY4 417 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 GCATO75600 419 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1QTNF9P0C862 333 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALPPL2P10696 532 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACP1P24666 158 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPN3P26045 913 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 HTR1BP28222 390 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM23P36406 574 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPHB1P54762 984 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 HS1BP3Q53T59 392 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENPP7Q6UWV6 458 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZVL8 140 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFAF2Q8N183 169 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA1524Q8TCG1 905 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 P3H4Q92791 437 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDXPQ96GD0 296 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 HEMGNQ9BXL5 484 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR26Q9H7D7 661 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 U3KQA8 63 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC66A2RUB6 948 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1SP09871 688 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPN7P35236 360 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 HK3P52790 923 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSDMDP57764 484 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 COPS2P61201 443 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 WASHC5Q12768 1159 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF5AQ12840 1032 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf61Q13536 156 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 QPCTQ16769 361 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFB133Q30KQ1 61 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX44Q53QW1 395 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRRT3Q5FWE3 981 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAXCQ5TGI0 409 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNCKQ6P2M8 343 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFLNAQ6ZTI6 216 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 NT5DC3Q86UY8 548 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 HID1Q8IV36 788 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM181AQ8N9Y4 354 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALG3Q92685 438 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 TADA1Q96BN2 335 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOLD1Q96LR9 279 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIB3Q96RU7 358 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYSMD1Q96S90 227 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUSP23Q9BVJ7 150 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 LGR4Q9BXB1 951 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC13A1Q9BZW2 595 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLPBQ9H078 707 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A51Q9H1U9 297 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGF22Q9HCT0 170 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCTD5Q9NXV2 234 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLQ9UEF7 1012 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM202A6NGA9 273 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASGRP1O95267 797 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOC2P02655 101 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 CKMT1AP12532 417 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYF5P13349 255 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSHRP16473 764 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF30P17039 623 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 BLKP51451 505 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 STC1P52823 247 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLDN6P56747 220 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRP54P61011 504 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 DAB2P98082 770 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTSQ03393 145 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 ILKQ13418 452 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC14A2Q15849 920 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 TXLNBQ8N3L3 684 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATL2Q8NHH9 583 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR1E3Q8WZA6 343 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEKT5Q96M29 485 aa19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms