RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293349.10

PLEKHH3-201, Transcript of pleckstrin homology, MyTH4 and FERM domain containing H3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene PLEKHH3, Length 2,987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHH3-201ENST00000293349 UBXN8O00124 270 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 LINC00032P0C843 101 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 PCSK1P29120 753 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 MAPK10P53779 464 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 ARPP19P56211 112 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 IKBKEQ14164 716 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 GRB7Q14451 532 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 ALFQ53S48 1182 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 TICAM1Q8IUC6 712 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 FAM47BQ8NA70 645 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 SPAG4Q9NPE6 437 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 TBCCD1Q9NVR7 557 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 OSER1Q9NX31 292 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 FAM50BQ9Y247 325 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 TIMM22Q9Y584 194 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 PLXNB2O15031 1838 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 SOCS2O14508 198 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 ATP6V1B2P21281 511 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 MFSD4BQ5TF39 518 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 HMBOX1Q6NT76 420 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 HBEGFQ99075 208 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 MID1IP1Q9NPA3 183 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 BCAP29Q9UHQ4 241 aa20.3■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 NRP2O60462 931 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 SRP72O76094 671 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 STAMBPO95630 424 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 CD52P31358 61 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 HADHAP40939 763 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 NR1H2P55055 460 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 STX5Q13190 355 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 LRP8Q14114 963 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 RANBP10Q6VN20 620 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 CYHR1Q6ZMK1 362 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 PELI3Q8N2H9 469 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 TRPC4APQ8TEL6 797 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 AP5M1Q9H0R1 490 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 RGS18Q9NS28 235 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 TREX1Q9NSU2 369 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 CROTQ9UKG9 612 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 VWA7Q9Y334 891 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 HTR3EA5X5Y0 456 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 H3BMM5 538 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 M0QZ92 97 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 NCK1P16333 377 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 GRK4P32298 578 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 CSRP3P50461 194 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 RELAQ04206 551 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 PSMD5Q16401 504 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 POTEHQ6S545 545 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 OR13J1Q8NGT2 312 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 NUDT8Q8WV74 236 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 VPS33AQ96AX1 596 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 EXOC2Q96KP1 924 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 IL12RB2Q99665 862 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 AKTIPQ9H8T0 292 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 TSC2P49815 1807 aa20.29■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 SERPINB7O75635 380 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 ADRA1AP35348 466 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 PRKAA2P54646 552 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 AIF1P55008 147 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 ADAM17P78536 824 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 POU4F1Q01851 419 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 AHI1Q8N157 1196 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZNF786Q8N393 782 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 DNAJB14Q8TBM8 379 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 ARMC7Q9H6L4 198 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 SH3BP2P78314 561 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 CDC42EP1Q00587 391 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 EFEMP1Q12805 493 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 GNASQ5JWF2 1037 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 FUNDC1Q8IVP5 155 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 OFCC1Q8IZS5 231 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 GSTO2Q9H4Y5 243 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZNF696Q9H7X3 374 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 NPHS1O60500 1241 aa20.28■□□□□ 0.84
PLEKHH3-201ENST00000293349 GFAPP14136 432 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms