RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
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RABGEF1-201ENST00000284957 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
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RABGEF1-201ENST00000284957 POLD2P49005 469 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 SEMG2Q02383 582 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 DLG1Q12959 904 aa9.34□□□□□ -0.91
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