RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SUV39H1O43463 412 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 GJB1P08034 283 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 FAM180AQ6UWF9 173 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 TTYH3Q9C0H2 523 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 HTR7P34969 479 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 COMMD2Q86X83 199 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 FAM47BQ8NA70 645 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 ASAH2Q9NR71 780 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 FAM105AQ9NUU6 356 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 MDM4O15151 490 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 CCNE2O96020 404 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 SLC26A3P40879 764 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 HADHBP55084 474 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 MAP2K5Q13163 448 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 USP41Q3LFD5 358 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 LPPQ93052 612 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 ABCB10Q9NRK6 738 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 NDOR1Q9UHB4 597 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 STON1Q9Y6Q2 735 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 ZW10O43264 779 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 CBFA2T3O75081 653 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 RAET1GQ6H3X3 334 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 CNSTQ6PJW8 725 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 EXOC2Q96KP1 924 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 MAF1Q9H063 256 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 IKZF4Q9H2S9 585 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 C5orf60A6NFR6 353 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 LSM3P62310 102 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF846Q147U1 533 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf62Q7Z3J2 963 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 SLC47A1Q96FL8 570 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 PLSCR1O15162 318 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 NEK5Q6P3R8 708 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 SLC26A9Q7LBE3 791 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 COLGALT2Q8IYK4 626 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 LEMD2Q8NC56 503 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 PPTC7Q8NI37 304 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 HEXDCQ8WVB3 486 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF607Q96SK3 696 aa21.15■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.14■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 RCVRNP35243 200 aa21.14■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 SPIBQ01892 262 aa21.14■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 GBE1Q04446 702 aa21.14■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 SMARCB1Q12824 385 aa21.14■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 CAMKK1Q8N5S9 505 aa21.14■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 FITM2Q8N6M3 262 aa21.14■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 GPR156Q8NFN8 814 aa21.14■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 COL26A1Q96A83 441 aa21.14■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 BRD9Q9H8M2 597 aa21.14■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.14■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 RPP40O75818 363 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 TUSC3Q13454 348 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PERM1Q5SV97 790 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 HECTD2Q5U5R9 776 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CNTD1Q8N815 330 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SMYD1Q8NB12 490 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 TLCD1Q96CP7 247 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 BTN2A3PQ96KV6 586 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CMTM6Q9NX76 183 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PTGFRNQ9P2B2 879 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 FADS3Q9Y5Q0 445 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 BMP7P18075 431 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ENPEPQ07075 957 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 GPR142Q7Z601 462 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 AP3S1Q92572 193 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 FAM84AQ96KN4 292 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 G3V2T6 193 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 OR10H3O60404 316 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PRG2P13727 222 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 MTAPQ13126 283 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 TCEA2Q15560 299 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PSMA8Q8TAA3 256 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CDH22Q9UJ99 828 aa21.14■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 TAF4O00268 1085 aa21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms