RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264389.6

COPS4-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS4, Length 1,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4-201ENST00000264389 ELSPBP1Q96BH3 223 aa8.32□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 ELMO2Q96JJ3 720 aa8.32□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.32□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 TSNARE1Q96NA8 513 aa8.32□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 KXD1Q9BQD3 176 aa8.32□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 MAGEE1Q9HCI5 957 aa8.32□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 DEC1Q9P2X7 70 aa8.32□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.32□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 GRID1Q9ULK0 1009 aa8.32□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 PKP3Q9Y446 797 aa8.32□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 CDH23Q9H251 3354 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 A0A096LPK6 155 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 A0A1W2PQ67 120 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 WDR91A4D1P6 747 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 ERICH4A6NGS2 130 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 TTC34A8MYJ7 566 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 HAUS5O94927 633 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 DLDP09622 509 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 NEFHP12036 1026 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 STMN1P16949 149 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 GABRB3P28472 473 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 MC4RP32245 332 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 ETV4P43268 484 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 SLC6A11P48066 632 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 SERPINB4P48594 390 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 POLD2P49005 469 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 RUNX3Q13761 415 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 GAB4Q2WGN9 574 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 USP45Q70EL2 814 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 CPLX4Q7Z7G2 160 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 LRRC34Q8IZ02 419 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 CHST14Q8NCH0 376 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 GPR150Q8NGU9 434 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 CCT8L2Q96SF2 557 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 S1PR5Q9H228 398 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 POMKQ9H5K3 350 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 BPIFA1Q9NP55 256 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 DCDC2Q9UHG0 476 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 PHTF1Q9UMS5 762 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 PLLPQ9Y342 182 aa8.31□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 WASH3PC4AMC7 463 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 C2P06681 752 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 GSTA1P08263 222 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 DHRS4L1P0CG22 281 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 LAMP2P13473 410 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 DRD4P21917 467 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 PMLP29590 882 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 GDI1P31150 447 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 HMGCLP35914 325 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 STC1P52823 247 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 RAB10P61026 200 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 POU4F1Q01851 419 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 SEMA3AQ14563 771 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 PTPRRQ15256 657 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 PTPRNQ16849 979 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 INSCQ1MX18 579 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 ZNF789Q5FWF6 425 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 PPM1JQ5JR12 505 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 FAM45BPQ6NSW5 357 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 CNSTQ6PJW8 725 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 PARM1Q6UWI2 310 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 GDPD4Q6W3E5 623 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 MTSS1LQ765P7 747 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 TERB1Q8NA31 727 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 ACVR1CQ8NER5 493 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 OR2A12Q8NGT7 310 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 TTC8Q8TAM2 541 aa8.3□□□□□ -1.08
COPS4-201ENST00000264389 FAM45AQ8TCE6 357 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms