RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 LCP2Q13094 533 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 XKR4Q5GH76 650 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 FAM72AQ5TYM5 149 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 OR52E8Q6IFG1 317 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 FAM72DQ6L9T8 149 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 GALNT7Q86SF2 657 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 FAM72BQ86X60 149 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SUSD3Q96L08 255 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 PPP3R2Q96LZ3 170 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 CIDEBQ9UHD4 219 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 RGS14O43566 566 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ACADVLP49748 655 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 RHDQ02161 417 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 RAB41Q5JT25 222 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 PPM1LQ5SGD2 360 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 UBXN11Q5T124 520 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 CNSTQ6PJW8 725 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 FNDC5Q8NAU1 212 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 LPCAT1Q8NF37 534 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ZNF696Q9H7X3 374 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SLC22A3O75751 556 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 CD52P31358 61 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SCNN1BP51168 640 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 TUBA4AP68366 448 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 DLG1Q12959 904 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 PIGGQ5H8A4 983 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 MTX3Q5HYI7 312 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 C6orf10Q5SRN2 563 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 C6orf52Q5T4I8 152 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 GPR158Q5T848 1215 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 PLGRKTQ9HBL7 147 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ADCY6O43306 1168 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 MSI1O43347 362 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 UROSP10746 265 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 LPOP22079 712 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 NAPRTQ6XQN6 538 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SATL1Q86VE3 508 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 NLGN2Q8NFZ4 835 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 FBXO27Q8NI29 283 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SEPT8Q92599 483 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 HMCESQ96FZ2 354 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 FTHL17Q9BXU8 183 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 MAGEH1Q9H213 219 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SCML2Q9UQR0 700 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SLC28A1O00337 649 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SDHDO14521 159 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 TPST1O60507 370 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 BEST1O76090 585 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 KCNH1O95259 989 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ALDH2P05091 517 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 TWF1Q12792 350 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 TECRLQ5HYJ1 363 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 KCTD11Q693B1 232 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 DDHD1Q8NEL9 900 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ASIC4Q96FT7 647 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 EPB41L1Q9H4G0 881 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 CD320Q9NPF0 282 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SCN3BQ9NY72 215 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 NUDT4Q9NZJ9 180 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB14O43829 449 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 CSPG5O95196 566 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 H6PDO95479 791 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 MT-CO1P00395 513 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 CYP11A1P05108 521 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 USP46P62068 366 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 IL1RL1Q01638 556 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 ZNF460Q14592 562 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 NR6A1Q15406 480 aa8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms