RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221232.9

CNOT3-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT3, Length 2,852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3-201ENST00000221232 LCA5Q86VQ0 697 aa14.64□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.64□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 SCML4Q8N228 414 aa14.64□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 C1orf74Q96LT6 269 aa14.64□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.64□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.64□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 EGFL7Q9UHF1 273 aa14.64□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 CES1P23141 567 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 SCNN1BP51168 640 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 HK2P52789 917 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 NDST2P52849 883 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 LRP8Q14114 963 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 LGI2Q8N0V4 545 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 RMDN1Q96DB5 314 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 MEAF6Q9HAF1 191 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 ARNT2Q9HBZ2 717 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 VPS45Q9NRW7 570 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 EPS15L1Q9UBC2 864 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 AP4S1Q9Y587 144 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 MYLKQ15746 1914 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 MROH6A6NGR9 719 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 ZNF839A8K0R7 811 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 CAP1Q01518 475 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 DUSP4Q13115 394 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 BEND5Q7L4P6 421 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 C19orf60Q96EN9 201 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 CIB1Q99828 191 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 BPIFA1Q9NP55 256 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 GALPQ9UBC7 116 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 PIP5K1BO14986 540 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 SLC7A4O43246 635 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 NRP2O60462 931 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 ADAMTS4O75173 837 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 TIPRLO75663 272 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 CKMT2P17540 419 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 TYMPP19971 482 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 SQLEQ14534 574 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 HERC3Q15034 1050 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 MTX3Q5HYI7 312 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 IFNEQ86WN2 208 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 PIF1Q9H611 641 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 ATP13A1Q9HD20 1204 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 SUPT3HB4E1H0 165 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 SEPT4O43236 478 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 SUPT3HO75486 399 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 CASP2P42575 452 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 ZFP1Q6P2D0 407 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 PAQR3Q6TCH7 311 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 FUNDC1Q8IVP5 155 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 HERC6Q8IVU3 1022 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 TUBGCP3Q96CW5 907 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 CCDC126Q96EE4 140 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 CROTQ9UKG9 612 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 AURKCQ9UQB9 309 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 C7orf72A4D263 438 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 ENPP3O14638 875 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 RHOBTB1O94844 696 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 CDK14O94921 469 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 CLPTM1O96005 669 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 CD1DP15813 335 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 UGT1A6P19224 532 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 GRIA3P42263 894 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 RGRP47804 291 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT3-201ENST00000221232 RPS24P62847 133 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms