RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638091.1

CACNB4-273, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 4,061 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-273	ENST00000638091	FTH1	P02794	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	UCHL3	P15374	230 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	PON1	P27169	355 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	FOXN2	P32314	431 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	KDSR	Q06136	332 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	CROCCP2	Q86T23	111 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	MAPK15	Q8TD08	544 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	NTNG2	Q96CW9	530 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	NEMP1	O14524	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	ADAM12	O43184	909 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	DPM1	O60762	260 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	CSF2	P04141	144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	CYP1A2	P05177	515 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	ARSA	P15289	507 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	CTNNA2	P26232	953 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	TPMT	P51580	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	SPIDR	Q14159	915 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	SCD5	Q86SK9	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	PSKH2	Q96QS6	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	RANBP9	Q96S59	729 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	CMKLR1	Q99788	373 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	FOXQ1	Q9C009	403 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	CLPB	Q9H078	707 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	RBSN	Q9H1K0	784 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	SIAH2	O43255	324 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	BUB1	O43683	1085 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	GJB3	O75712	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	LIPC	P11150	499 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	ICAM2	P13598	275 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	ZNF24	P17028	368 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	GLDC	P23378	1020 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	ITGA3	P26006	1051 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	SLC19A1	P41440	591 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	JAM2	P57087	298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	TUBA1B	P68363	451 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	PPARD	Q03181	441 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	TGM3	Q08188	693 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	COX10	Q12887	443 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	PKP1	Q13835	747 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	LRRC14	Q15048	493 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	TUBA1A	Q71U36	451 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-273	ENST00000638091	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		4.59	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.8 ms