RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635438.1

TUBBP5-204, Transcript of tubulin beta pseudogene 5, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TUBBP5, Length 565 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP5-204ENST00000635438 LRRN4Q8WUT4 740 aa23.09■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 LGR4Q9BXB1 951 aa23.09■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 A0A0U1RQS6 177 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 SOCS5O75159 536 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 PROSCO94903 275 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 TNFP01375 233 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 ALPIP09923 528 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 ABCG1P45844 678 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 GABREP78334 506 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 ITKQ08881 620 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 CNGA3Q16281 694 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 ISXQ2M1V0 245 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 KYQ8NBH2 561 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 OR56A4Q8NGH8 313 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 ATL2Q8NHH9 583 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 FGF11Q92914 225 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 COQ10AQ96MF6 247 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 CCDC3Q9BQI4 270 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 FGF22Q9HCT0 170 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 GPR34Q9UPC5 381 aa23.08■■□□□ 1.29
TUBBP5-204ENST00000635438 ANKRD36A6QL64 1941 aa23.08■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 H2AFZP0C0S5 128 aa23.07■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 CTPS1P17812 591 aa23.07■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 VIPR1P32241 457 aa23.07■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 ACTN2P35609 894 aa23.07■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 SLC18A3Q16572 532 aa23.07■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 TBC1D25Q3MII6 688 aa23.07■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa23.07■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa23.07■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 PNCKQ6P2M8 343 aa23.07■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 H2AFVQ71UI9 128 aa23.07■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 OR8K1Q8NGG5 319 aa23.07■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa23.07■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 SMIM14Q96QK8 99 aa23.07■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 DEF6Q9H4E7 631 aa23.07■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 MOSPD1Q9UJG1 213 aa23.07■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 RRP8O43159 456 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 LHCGRP22888 699 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 TRIM23P36406 574 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 ETV3P41162 512 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 GARSP41250 739 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 KIAA1024LP59773 190 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 CCDC173Q0VFZ6 552 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 LVRNQ6Q4G3 990 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 TSPAN33Q86UF1 283 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 GKN2Q86XP6 184 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 TEX26Q8N6G2 289 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 ARL10Q8N8L6 244 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 SPOCK2Q92563 424 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 NAT6Q93015 286 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 NUS1Q96E22 293 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 DNAJC7Q99615 494 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 SEMA3CQ99985 751 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 WDR26Q9H7D7 661 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 CYP4F12Q9HCS2 524 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 UVRAGQ9P2Y5 699 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 RABGEF1Q9UJ41 708 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 PHTF1Q9UMS5 762 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 RAI2Q9Y5P3 530 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 DGKBQ9Y6T7 804 aa23.06■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 A0A1W2PQ67 120 aa23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 PGLSO95336 258 aa23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 PDHA1P08559 390 aa23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 GALNT2Q10471 571 aa23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 ARMC12Q5T9G4 340 aa23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 TAF8Q7Z7C8 310 aa23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 SFTPA2Q8IWL1 248 aa23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 TPCN2Q8NHX9 752 aa23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 CCDC74AQ96AQ1 378 aa23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 TMEM168Q9H0V1 697 aa23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 SATB2Q9UPW6 733 aa23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 TTLL3Q9Y4R7 772 aa23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 CACNA1GO43497 2377 aa23.05■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 ASXL3Q9C0F0 2248 aa23.04■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 GOLGA6CA6NDK9 693 aa23.04■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 GOLGA6BA6NDN3 693 aa23.04■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 CBFA2T2O43439 604 aa23.04■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 GOLGA6DP0CG33 693 aa23.04■■□□□ 1.28
TUBBP5-204ENST00000635438 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms