RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	AK5	Q9Y6K8	562 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	TLR5	O60602	858 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	GLP2R	O95838	553 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SREBF2	Q12772	1141 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	RALGDS	Q12967	914 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SEMA3A	Q14563	771 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC126	Q96EE4	140 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	LRGUK	Q96M69	825 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	GBP5	Q96PP8	586 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM14	Q96QK8	99 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	RANBP9	Q96S59	729 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SPON2	Q9BUD6	331 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	RNF186	Q9NXI6	227 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SLC22A2	O15244	555 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	FOLH1	Q04609	750 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	LGI2	Q8N0V4	545 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PELI3	Q8N2H9	469 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	TEX26	Q8N6G2	289 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	FNIP2	Q9P278	1114 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PML	P29590	882 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	IL10RB	Q08334	325 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	FAM26D	Q5JW98	314 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PAOX	Q6QHF9	649 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	RNF180	Q86T96	592 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	LILRA2	Q8N149	483 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	OR7D4	Q8NG98	312 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PDP2	Q9P2J9	529 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ASB3	Q9Y575	518 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	MTMR11	A4FU01	709 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152		E7ENX8	843 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PSME3	P61289	254 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	HERC3	Q15034	1050 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PFKFB4	Q16877	469 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	C3orf30	Q96M34	536 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	NACA2	Q9H009	215 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152		C9JVG2	144 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	UBXN8	O00124	270 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	IMPDH1	P20839	514 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	POLE2	P56282	527 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PARP15	Q460N3	678 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	FBP2	O00757	339 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	INPPL1	O15357	1258 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	TACR2	P21452	398 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SCNN1B	P51168	640 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	PDK3	Q15120	406 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SLC14A2	Q15849	920 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-222	ENST00000635152	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms