RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	SERPINA4	P29622	427 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	SUOX	P51687	545 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	OR1D5	P58170	312 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	MTM1	Q13496	603 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ARHGEF7	Q14155	803 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	LINC00303	Q3SY05	128 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	NPW	Q8N729	165 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM74	Q96NL1	305 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	B4GAT1	O43505	415 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	FUCA1	P04066	466 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	GLB1	P16278	677 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ALDH4A1	P30038	563 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	POLD2	P49005	469 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	MAMLD1	Q13495	774 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	GRM3	Q14832	879 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	PNCK	Q6P2M8	343 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	RFX8	Q6ZV50	586 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ATL2	Q8NHH9	583 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	PATE1	Q8WXA2	126 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	CAPN8	A6NHC0	703 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	CCL4	P13236	92 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ATP1A3	P13637	1013 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	FER	P16591	822 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	MPST	P25325	297 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	MIP	P30301	263 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	AIF1	P55008	147 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	AGER	Q15109	404 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	DPPA4	Q7L190	304 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	SPRED1	Q7Z699	444 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	SMIM14	Q96QK8	99 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-262	ENST00000628078	PRSS38	A1L453	326 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	C9orf172	C9J069	976 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	RNF8	O76064	485 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	FGF1	P05230	155 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	FAM87A	P0C7U9	286 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	DES	P17661	470 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CTPS1	P17812	591 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	AMPD1	P23109	780 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CCKBR	P32239	447 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	GNPDA1	P46926	289 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CSNK1D	P48730	415 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	KIAA1024L	P59773	190 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	MAX	P61244	160 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	B4GALNT1	Q00973	533 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	MYL5	Q02045	173 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	IL10RB	Q08334	325 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	MAP9	Q49MG5	647 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	MANEA	Q5SRI9	462 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	AFMID	Q63HM1	303 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	DOK6	Q6PKX4	331 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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