RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 PAF1Q8N7H5 531 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 TBATAQ96M53 351 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 GUCD1Q96NT3 240 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 LYSMD1Q96S90 227 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 RBBP8Q99708 897 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNK12Q9HB15 430 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPN8A6NHC0 703 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 CCL22O00626 93 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 LEFTY1O75610 366 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 CTSLP07711 333 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 BRAFP15056 766 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 FOSL2P15408 326 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 HNF1BP35680 557 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 GALK1P51570 392 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 PRAMEP78395 509 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 TMPRSS15P98073 1019 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 BMPR2Q13873 1038 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 ARSIQ5FYB1 569 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4K2Q8NGD2 314 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 CALML6Q8TD86 181 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 HLA-CQ95604 372 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL32Q96NJ5 620 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 LIMD1Q9UGP4 676 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAM21Q9UKJ8 722 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 STARD13Q9Y3M8 1113 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 EYSQ5T1H1 3165 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 MT-ND3P03897 115 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP1A2P50993 1020 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 CDKN3Q16667 212 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 C9orf64Q5T6V5 341 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 MROH9Q5TGP6 573 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 MICALCLQ6ZW33 695 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 DENND6AQ8IWF6 608 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC44A3Q8N4M1 653 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 PPM1EQ8WY54 764 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 SCRN2Q96FV2 425 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 SERAC1Q96JX3 654 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPAN11A1L157 253 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGA2BP08514 1039 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 HLA-EP13747 358 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 SPRP35270 261 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 HMGCLP35914 325 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 CTBP1Q13363 440 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 BRAT1Q6PJG6 821 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 TIFABQ6ZNK6 161 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 SH2D5Q6ZV89 423 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 LMNTD2Q8IXW0 634 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFAF2Q8N183 169 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6P1Q8NGX9 317 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 HCAR2Q8TDS4 363 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 EID2BQ96D98 161 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 SMC6Q96SB8 1091 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 P2RY13Q9BPV8 354 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR63Q9BZJ6 419 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 IL17CQ9P0M4 197 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0U1RQS6 177 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC162PA2VCL2 907 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 ANTXRLA6NF34 631 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 GOT2P00505 430 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT4P19013 534 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 GABRB3P28472 473 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 IL12RB1P42701 662 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC1A2P43004 574 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 LIMK2P53671 638 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJC3Q13217 504 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 UGP2Q16851 508 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF470Q6ECI4 717 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA0408Q6ZU52 694 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 C4orf33Q8N1A6 199 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 C19orf43Q9BQ61 176 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 SELENOSQ9BQE4 189 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO5Q9UKT4 447 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 OR51F1A6NGY5 319 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 STX7O15400 261 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 RFPL1O75677 317 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC4A1P02730 911 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 AHSGP02765 367 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 F7P08709 466 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
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