RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	MCL1	Q07820	350 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	KYAT1	Q16773	422 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	STRADA	Q7RTN6	431 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	VPS36	Q86VN1	386 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	MFN1	Q8IWA4	741 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	NCSTN	Q92542	709 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	PDXP	Q96GD0	296 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF747	Q9BV97	191 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	CUEDC2	Q9H467	287 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	IL37	Q9NZH6	218 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ZFAT	Q9P243	1243 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	DERA	Q9Y315	318 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A087WWV3	80 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLON5	A6NGN9	336 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC69	A6NI79	296 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	CLCA1	A8K7I4	914 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	MCF2L	O15068	1137 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	PPM1D	O15297	605 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	GOSR1	O95249	250 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	TIAF1	O95411	115 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	CYP3A7	P24462	503 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	LMO2	P25791	158 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ARG2	P78540	354 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	LAPTM4A	Q15012	233 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	USP45	Q70EL2	814 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	C1QL4	Q86Z23	238 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	BICD2	Q8TD16	824 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	TBCK	Q8TEA7	893 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR137	Q96N19	417 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	CHST8	Q9H2A9	424 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	OSER1	Q9NX31	292 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	MED29	Q9NX70	200 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP8B3	O60423	1300 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM227A	F5H4B4	570 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	BNIP3L	O60238	219 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	TBL1X	O60907	577 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	WISP2	O76076	250 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	PDGFRB	P09619	1106 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	PEX5	P50542	639 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	SLFN5	Q08AF3	891 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	STRN3	Q13033	797 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	NFATC4	Q14934	902 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	POU4F3	Q15319	338 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ACCSL	Q4AC99	568 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	AWAT1	Q58HT5	328 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ELOA3	Q8NG57	546 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	ASB12	Q8WXK4	309 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF34	Q969K3	372 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	TNIP3	Q96KP6	325 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNK16	Q96T55	309 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC38A3	Q99624	504 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	NLN	Q9BYT8	704 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	C2CD2	Q9Y426	696 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	DYTN	A2CJ06	578 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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