RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 ACOX1Q15067 660 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 CNGA3Q16281 694 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 PERM1Q5SV97 790 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 PNCKQ6P2M8 343 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 RD3Q7Z3Z2 195 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 PELI3Q8N2H9 469 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 ATL2Q8NHH9 583 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 MAML1Q92585 1016 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 FAF2Q96CS3 445 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 TSGA13Q96PP4 275 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 DEPDC7Q96QD5 511 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 CHP1Q99653 195 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF670Q9BS34 389 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 NT5MQ9NPB1 228 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 KLQ9UEF7 1012 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 LCMT1Q9UIC8 334 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 PPIL1Q9Y3C6 166 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 DGKBQ9Y6T7 804 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 TMEM202A6NGA9 273 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 PGLSO95336 258 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 TNFP01375 233 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 KRT7P08729 469 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 ALPIP09923 528 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 CTSEP14091 401 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 VIPR1P32241 457 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 GJC1P36383 396 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 MAP7D3Q8IWC1 876 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 PQLC3Q8N755 202 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 TPCN2Q8NHX9 752 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 PIH1D2Q8WWB5 315 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 OR1E3Q8WZA6 343 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 FATE1Q969F0 183 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 SCRN2Q96FV2 425 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 LGR4Q9BXB1 951 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 PADI4Q9UM07 663 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 ADAMTS20P59510 1910 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 MATN3O15232 486 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 BRINP1O60477 761 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 CSO75390 466 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 CCNCP24863 283 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 MAN1A1P33908 653 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 IHHQ14623 411 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 PTPRRQ15256 657 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 OR56A4Q8NGH8 313 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC35G2Q8TBE7 412 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 SEMA3CQ99985 751 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 DEF6Q9H4E7 631 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 ABHD10Q9NUJ1 306 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKRD36A6QL64 1941 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 TNFRSF10CO14798 259 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 AKR1B10O60218 316 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 FZD6O60353 706 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 LHCGRP22888 699 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 KDELR1P24390 212 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 ISXQ2M1V0 245 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 ARMC12Q5T9G4 340 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 ALG1LQ6GMV1 187 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 GKN2Q86XP6 184 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 RAPGEF5Q92565 580 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 NAT6Q93015 286 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 PDXPQ96GD0 296 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 FGF22Q9HCT0 170 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 KCTD5Q9NXV2 234 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 GULP1Q9UBP9 304 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 DOLKQ9UPQ8 538 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 RAI2Q9Y5P3 530 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 USP12O75317 370 aa23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 MAP3K6O95382 1288 aa23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 PDHA1P08559 390 aa23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 MESDQ14696 234 aa23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 TCEA2Q15560 299 aa23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 PDZD3Q86UT5 571 aa23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 ARL10Q8N8L6 244 aa23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 FGF11Q92914 225 aa23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 NUS1Q96E22 293 aa23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 AMACRQ9UHK6 382 aa23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 GPR34Q9UPC5 381 aa23.58■■□□□ 1.37
PPP1CC-211ENST00000620030 ITPR1Q14643 2758 aa23.57■■□□□ 1.36
PPP1CC-211ENST00000620030 CASC3O15234 703 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms