RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ELFN1P0C7U0 828 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 COL6A2P12110 1019 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 HK2P52789 917 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 BLVRAP53004 296 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ISLR2Q6UXK2 745 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 HSMCR30P0CW71 290 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CREB1P16220 341 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMG2Q969U7 264 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCG8Q9H221 673 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 PBX3P40426 434 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 PCYT1AP49585 367 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 UBE2E3Q969T4 207 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC4A5Q9BY07 1137 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNE2Q9Y6J6 123 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TNNI3P19429 210 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 XKR6Q5GH73 641 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 FGD3Q5JSP0 725 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM110Q86TL2 294 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 QRFPRQ96P65 431 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 MAGEH1Q9H213 219 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 BRD9Q9H8M2 597 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 IPO13O94829 963 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TNFAIP8O95379 198 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 PRKCQQ04759 706 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 SULT2A1Q06520 285 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TEKT5Q96M29 485 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ARL8BQ9NVJ2 186 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CAPZA2P47755 286 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF276Q8N554 614 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 STYXQ8WUJ0 223 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TLCD1Q96CP7 247 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 METTL18O95568 372 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 AP3M1Q9Y2T2 418 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 SGTAO43765 313 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 PEX1O43933 1283 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ANXA6P08133 673 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 NMBRP28336 390 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 HNF4AP41235 474 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 NRLP54845 237 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 DEFA1P59665 94 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 DEFA3P59666 94 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR156Q8NFN8 814 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 SCLYQ96I15 445 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM245Q9H330 911 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ATAD3AQ9NVI7 634 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM38O00635 465 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CCL16O15467 120 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMB9P28065 219 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ULK2Q8IYT8 1036 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 LRP6O75581 1613 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 GRM6O15303 877 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 STBD1O95210 358 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 RANBP1P43487 201 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CDH4P55283 916 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP20A1Q6UW02 462 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 TDRPQ86YL5 185 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 RIBC2Q9H4K1 309 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 ENTPD4Q9Y227 616 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.7■□□□□ 0.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CRATP43155 626 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-208ENST00000615445 PRRG3Q9BZD7 231 aa20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms