RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 C5orf60A6NFR6 353 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CFAP73A6NFT4 308 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 A6NHS1 94 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 M0QYT0 321 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 B4GAT1O43505 415 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 KRT86O43790 486 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 VNN1O95497 513 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 THRAP10827 490 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CD1EP15812 388 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 GAP43P17677 238 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CD151P48509 253 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SLC11A2P49281 568 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CCNG1P51959 295 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 PGDP52209 483 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 THOP1P52888 689 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 PLK1P53350 603 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 PPARDQ03181 441 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CCDC15Q0P6D6 951 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SEMA5AQ13591 1074 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SLC12A1Q13621 1099 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 NR1I3Q14994 352 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 NR1D2Q14995 579 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 DLG2Q15700 870 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 DCAF12Q5T6F0 453 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 FAXCQ5TGI0 409 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SLC6A19Q695T7 634 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SLC30A9Q6PML9 568 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ZNF438Q7Z4V0 828 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CDH24Q86UP0 819 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 PIM3Q86V86 326 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 PIGZQ86VD9 579 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CFAP52Q8N1V2 620 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 MLKLQ8NB16 471 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 TMIEQ8NEW7 156 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ASB12Q8WXK4 309 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CCDC127Q96BQ5 260 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ALG14Q96F25 216 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 AK8Q96MA6 479 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ULBP1Q9BZM6 244 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 KIAA1586Q9HCI6 787 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 OCIAD1Q9NX40 245 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 FADS3Q9Y5Q0 445 aa11.79□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GTH6 734 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 GOLGA6L10A6NI86 522 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 AP1G1O43747 822 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ZG16O60844 167 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 HSF2BPO75031 334 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 NADKO95544 446 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ZBED1O96006 694 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CHRNA3P32297 505 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 LSP1P33241 339 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 NDUFA8P51970 172 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 LIMK2P53671 638 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP10-9P60411 292 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 MAP7Q14244 749 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 TCEA2Q15560 299 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ALG11Q2TAA5 492 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 EDRF1Q3B7T1 1238 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 C14orf28Q4W4Y0 310 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 GKN2Q86XP6 184 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SLC35F6Q8N357 371 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 MREGQ8N565 214 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SH2D3CQ8N5H7 860 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 OR2A12Q8NGT7 310 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 RASSF8Q8NHQ8 419 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 MIPOL1Q8TD10 442 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 PLEKHO2Q8TD55 490 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 EDEM1Q92611 657 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CENPTQ96BT3 561 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 CALML4Q96GE6 196 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 ASF1BQ9NVP2 202 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 LRIT1Q9P2V4 623 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 HPSEQ9Y251 543 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 C15orf41Q9Y2V0 281 aa11.78□□□□□ -0.52
HCG18-241ENST00000602290 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ATP1A3P13637 1013 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ADRB3P13945 408 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PDGFRAP16234 1089 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CSF2RBP32927 897 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 HOXD13P35453 343 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 BLKP51451 505 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TKTL1P51854 596 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 NEK3P51956 506 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 YPEL5P62699 121 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 NCOA4Q13772 614 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 BLMHQ13867 455 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ERV3-1Q14264 604 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 STK38Q15208 465 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 BSPRYQ5W0U4 402 aa11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms