RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	FBRS	Q9HAH7	460 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	HCN2	Q9UL51	889 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	CHKB	Q9Y259	395 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	MROH6	A6NGR9	719 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	AXIN1	O15169	862 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	HR	O43593	1189 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	GJB3	O75712	270 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	CRTAM	O95727	393 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	CP	P00450	1065 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	PDHA1	P08559	390 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	TIE1	P35590	1138 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	GPX6	P59796	221 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	OLIG2	Q13516	323 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	STAT4	Q14765	748 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	RASA2	Q15283	850 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	DENND2C	Q68D51	928 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	SDE2	Q6IQ49	451 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	GAB3	Q8WWW8	586 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	RMDN1	Q96DB5	314 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	SCRN2	Q96FV2	425 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	GABRG3	Q99928	467 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	APOL2	Q9BQE5	337 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	SYBU	Q9NX95	663 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	IL36A	Q9UHA7	158 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	NFS1	Q9Y697	457 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	TPH1	P17752	444 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	PRKCH	P24723	683 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	NTSR1	P30989	418 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	STX2	P32856	288 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	IL12RB1	P42701	662 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	CHRNA4	P43681	627 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	DGKE	P52429	567 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	ACVR1	Q04771	509 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	QPCT	Q16769	361 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	EOGT	Q5NDL2	527 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	ANO7	Q6IWH7	933 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	MPP5	Q8N3R9	675 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	SGSM3	Q96HU1	749 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	FAM129B	Q96TA1	746 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	FRYL	O94915	3013 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	CEP250	Q9BV73	2442 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392		A0A0J9YYE9	177 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	LDB2	O43679	373 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	LEFTY1	O75610	366 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	SASH3	O75995	380 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	TRBC1	P01850	177 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	RET	P07949	1114 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	SSTR1	P30872	391 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	EPHB1	P54762	984 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	SPEM2	Q0P670	501 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	NAB1	Q13506	487 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CELF4-222	ENST00000601392	EMC10	Q5UCC4	262 aa		12.8	□□□□□ -0.36

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